Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

GGTLC3

gamma-glutamyltransferase light chain family member 3

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
22q11.21
Koordináták
22. kromoszóma: 18 516 344–18 518 161 (GRCh38)
Exonok
6 exon, összesen 1,8 kb
Fehérje
225 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000619998.1NM_001355479.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) GGTLC3 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A GGTLC3 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
22. kromoszóma, a GGTLC3 helyét zárójel jelöli. A GGTLC3 és környékén 11 gén a 22. kromoszómán, 18 017 253–19 017 252 között.22. kromoszóma22q11.21p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3318,2 Mb18,4 Mb18,6 Mb18,8 Mb19 MbMICAL3: 17 787 649–18 024 561, fordított szálMICAL3PEX26: 18 077 910–18 105 396, előre szálPEX26: 18 077 989–18 131 720, előre szálTUBA8: 18 109 704–18 146 683, előre szálTUBA8USP18: 18 148 399–18 177 400, előre szálUSP18GGTLC3: 18 516 344–18 518 161, fordított szálGGTLC3TMEM191B: 18 527 802–18 530 573, előre szálTMEM191BRIMBP3: 18 605 815–18 611 919, fordított szálRIMBP3FAM246B: 18 633 984–18 634 682, előre szálFAM246BDGCR6: 18 905 677–18 916 623, előre szálDGCR6: 18 906 238–18 947 732, előre szálPRODH: 18 912 696–18 936 451, fordított szálPRODHA GGTLC3 ábrája: 6 exon a(z) 22. kromoszóma fordított szálán6. exon: 18 516 344–18 516 647, 304 bázis5. exon: 18 516 952–18 517 065, 114 bázis4. exon: 18 517 147–18 517 259, 113 bázis3. exon: 18 517 362–18 517 489, 128 bázis2. exon: 18 517 722–18 517 931, 210 bázis1. exon: 18 518 063–18 518 161, 99 bázis6543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 1,8 kb-jából 1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 678 bázis kódolja a fehérjét.

GGTLC3 szekvenálása

100Nehéz

Mennyire nehéz a GGTLC3 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A GGTLC3 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a GGTLC3 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség100%
  • Homológia100%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések0,6%
  • GC-tartalom16%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). GGTLC3 gén: gamma-glutamyltransferase light chain family member 3. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ggtlc3

Vancouver

Dante Labs. GGTLC3 gén: gamma-glutamyltransferase light chain family member 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ggtlc3

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet