Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

FAM89A

family with sequence similarity 89 member A

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
1q42.2
Koordináták
1. kromoszóma: 231 018 958–231 040 254 (GRCh38)
Exonok
2 exon, összesen 21,3 kb
Fehérje
184 aminosav, 19,6 kDa
Más néven ismert
MGC15887
Korábbi jelölések
C1orf153
MANE Select transzkriptum
ENST00000366654.5NM_198552.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) FAM89A gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A FAM89A felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
1. kromoszóma, a FAM89A helyét zárójel jelöli. A FAM89A és környékén 15 gén a 1. kromoszómán, 230 529 606–231 529 605 között.1. kromoszóma1q42.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44230,6 Mb230,8 Mb231 Mb231,2 Mb231,4 MbCOG2: 230 642 440–230 693 985, előre szálCOG2AGT: 230 690 776–230 745 576, fordított szálAGTCAPN9: 230 747 266–230 804 397, előre szálCAPN9C1orf198: 230 837 119–230 869 589, fordított szálC1orf198TTC13: 230 902 936–230 978 893, fordított szálTTC13ARV1: 230 978 981–231 000 735, előre szálARV1FAM89A: 231 018 958–231 040 254, fordított szálFAM89ATRIM67: 231 162 058–231 221 565, előre szálTRIM67FSAF1: 231 223 763–231 241 187, fordított szálFSAF1GNPAT: 231 241 184–231 277 973, előre szálGNPATEXOC8: 231 332 753–231 337 852, fordított szálEXOC8SPRTN: 231 337 104–231 375 416, előre szálSPRTNEGLN1: 231 359 560–231 422 749, fordított szálEGLN1: 231 363 797–231 528 603, fordított szálTSNAX: 231 528 541–231 566 524, előre szálTSNAXTSNAX-DISC1: 231 528 653–231 819 244, előre szálTSNAX-DISC1A FAM89A ábrája: 2 exon a(z) 1. kromoszóma fordított szálán2. exon: 231 018 958–231 020 126, 1169 bázis1. exon: 231 039 921–231 040 254, 334 bázis215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 21,3 kb-jából 1,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 555 bázis kódolja a fehérjét.

FAM89A szekvenálása

6Könnyű

Mennyire nehéz a FAM89A rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A FAM89A exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a FAM89A exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések5,1%
  • GC-tartalom22%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). FAM89A gén: family with sequence similarity 89 member A. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/fam89a

Vancouver

Dante Labs. FAM89A gén: family with sequence similarity 89 member A [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/fam89a

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet