Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ARHGEF40

Rho guanine nucleotide exchange factor 40

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
14q11.2
Koordináták
14. kromoszóma: 21 070 304–21 090 248 (GRCh38)
Exonok
24 exon, összesen 19,9 kb
Fehérje
1519 aminosav
Más néven ismert
solo, FLJ10357
MANE Select transzkriptum
ENST00000298694.9NM_018071.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ARHGEF40 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ARHGEF40 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
14. kromoszóma, a ARHGEF40 helyét zárójel jelöli. A ARHGEF40 és környékén 32 gén a 14. kromoszómán, 20 580 276–21 580 275 között.14. kromoszóma14q11.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3320,6 Mb20,8 Mb21 Mb21,2 Mb21,4 MbRNASE11: 20 582 892–20 609 884, fordított szálRNASE11: 20 582 892–20 609 795, fordított szálRNASE12: 20 590 073–20 591 376, fordított szálRNASE12OR6S1: 20 640 696–20 641 691, fordított szálOR6S1RNASE4: 20 681 073–20 701 216, előre szálRNASE4ANG: 20 682 866–20 698 971, előre szálANG: 20 684 587–20 700 576, előre szálEDDM3A: 20 745 887–20 748 380, előre szálEDDM3AEDDM3B: 20 768 404–20 770 948, előre szálEDDM3BRNASE6: 20 781 031–20 783 793, előre szálRNASE6RNASE1: 20 801 228–20 802 884, fordított szálRNASE1RNASE3: 20 882 394–20 892 348, előre szálRNASE3RNASE2: 20 955 345–20 956 436, előre szálRNASE2METTL17: 20 989 775–20 997 035, előre szálSLC39A2: 20 999 255–21 001 871, előre szálNDRG2: 21 016 584–21 071 094, fordított szálTPPP2: 21 024 086–21 036 276, előre szálTPPP2RNASE13: 21 032 818–21 034 807, fordított szálRNASE7: 21 042 316–21 044 234, előre szálRNASE8: 21 057 822–21 058 455, előre szálRNASE8ARHGEF40: 21 070 304–21 090 248, előre szálARHGEF40ZNF219: 21 089 468–21 104 722, fordított szálZNF219TMEM253: 21 098 811–21 103 724, előre szálTMEM253OR5AU1: 21 148 370–21 159 060, fordított szálOR5AU1HNRNPC: 21 207 375–21 269 792, fordított szálHNRNPCRPGRIP1: 21 280 083–21 351 301, előre szálRPGRIP1SUPT16H: 21 351 289–21 384 042, fordított szálSUPT16HCHD8: 21 385 194–21 456 126, fordított szálCHD8RAB2B: 21 458 704–21 476 973, fordított szálRAB2BTOX4: 21 476 597–21 504 234, előre szálTOX4METTL3: 21 498 127–21 511 430, fordított szálMETTL3SALL2: 21 521 080–21 537 230, fordított szálSALL2OR10G3: 21 568 520–21 580 076, fordított szálOR10G3A ARHGEF40 ábrája: 24 exon a(z) 14. kromoszóma előre szálán1. exon: 21 070 304–21 070 399, 96 bázis2. exon: 21 073 045–21 073 242, 198 bázis3. exon: 21 073 932–21 075 180, 1249 bázis4. exon: 21 075 332–21 075 499, 168 bázis5. exon: 21 075 645–21 075 765, 121 bázis6. exon: 21 076 360–21 076 456, 97 bázis7. exon: 21 076 563–21 076 643, 81 bázis8. exon: 21 076 774–21 076 890, 117 bázis9. exon: 21 078 177–21 078 272, 96 bázis10. exon: 21 078 373–21 078 488, 116 bázis11. exon: 21 078 884–21 079 010, 127 bázis12. exon: 21 080 660–21 080 782, 123 bázis13. exon: 21 080 873–21 081 016, 144 bázis14. exon: 21 081 509–21 082 119, 611 bázis15. exon: 21 082 244–21 082 478, 235 bázis16. exon: 21 082 831–21 082 917, 87 bázis17. exon: 21 083 835–21 084 050, 216 bázis18. exon: 21 084 753–21 084 923, 171 bázis19. exon: 21 085 689–21 085 866, 178 bázis20. exon: 21 087 001–21 087 105, 105 bázis21. exon: 21 087 320–21 087 463, 144 bázis22. exon: 21 087 968–21 088 098, 131 bázis23. exon: 21 088 830–21 088 876, 47 bázis24. exon: 21 089 014–21 090 248, 1235 bázis1246810121416182022245′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 19,9 kb-jából 5,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4560 bázis kódolja a fehérjét.

ARHGEF40 szekvenálása

7Könnyű

Mennyire nehéz a ARHGEF40 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ARHGEF40 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a ARHGEF40 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések1,5%
  • GC-tartalom32%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ARHGEF40 gén: Rho guanine nucleotide exchange factor 40. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/arhgef40

Vancouver

Dante Labs. ARHGEF40 gén: Rho guanine nucleotide exchange factor 40 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/arhgef40

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet