Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

APOBR

apolipoprotein B receptor

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
16p12.1
Koordináták
16. kromoszóma: 28 494 643–28 498 964 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 4,3 kb
Fehérje
1097 aminosav
Más néven ismert
APOB48R, APOB100R
MANE Select transzkriptum
ENST00000564831.6NM_018690.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) APOBR gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A APOBR felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
16. kromoszóma, a APOBR helyét zárójel jelöli. A APOBR és környékén 25 gén a 16. kromoszómán, 27 996 804–28 996 803 között.16. kromoszóma16p12.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.328 Mb28,2 Mb28,4 Mb28,6 Mb28,8 MbGSG1L: 27 787 526–28 063 754, fordított szálGSG1LXPO6: 28 097 976–28 212 065, fordított szálXPO6SBK1: 28 259 246–28 323 849, előre szálSBK1NPIPB6: 28 342 517–28 363 508, fordított szálNPIPB6EIF3CL: 28 376 676–28 403 851, fordított szálEIF3CLNPIPB7: 28 456 322–28 472 336, fordított szál: 28 456 371–28 492 098, fordított szálCLN3: 28 474 111–28 495 575, fordított szálCLN3APOBR: 28 494 643–28 498 964, előre szálAPOBRIL27: 28 499 360–28 512 051, fordított szálIL27NUPR1: 28 532 708–28 539 068, fordított szálNUPR1SGF29: 28 538 176–28 591 792, előre szálSGF29SULT1A2: 28 589 688–28 599 913, fordított szálSULT1A2SULT1A1: 28 604 997–28 612 503, fordított szálSULT1A1NPIPB8: 28 637 654–28 658 744, előre szálNPIPB8EIF3C: 28 688 558–28 745 938, előre szálEIF3CNPIPB9: 28 751 787–28 772 864, előre szálNPIPB9ATXN2L: 28 822 983–28 837 237, előre szálATXN2LTUFM: 28 841 618–28 846 419, fordított szálTUFMSH2B1: 28 846 584–28 875 103, előre szálSH2B1ATP2A1: 28 878 383–28 904 511, előre szálATP2A1RABEP2: 28 898 740–28 936 526, fordított szálRABEP2CD19: 28 931 965–28 939 342, előre szálCD19NFATC2IP: 28 950 807–28 967 092, előre szálNFATC2IPSPNS1: 28 974 126–28 984 548, előre szálSPNS1LAT: 28 984 808–28 990 784, előre szálLATA APOBR ábrája: 4 exon a(z) 16. kromoszóma előre szálán1. exon: 28 494 643–28 494 738, 96 bázis2. exon: 28 495 099–28 497 996, 2898 bázis3. exon: 28 498 081–28 498 349, 269 bázis4. exon: 28 498 436–28 498 964, 529 bázis12345′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 4,3 kb-jából 3,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3294 bázis kódolja a fehérjét.

APOBR szekvenálása

6Könnyű

Mennyire nehéz a APOBR szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-as skálán

A APOBR exonjainak szinte mindegyike olyan helyen található, ahol a rövid olvasatok tisztán illeszthetők.

Ehhez hozzájárul: a APOBR exonjainak aránya az egyes nehéz régiótípusokban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések11%
  • GC-tartalom43%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle nehezen szekvenálható régiókat bemutató térképeire épül.Hogyan számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). APOBR gén: apolipoprotein B receptor. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/apobr

Vancouver

Dante Labs. APOBR gén: apolipoprotein B receptor [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/apobr

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet