Gén
ADAM33
ADAM metallopeptidase domain 33
- HGNC 15478↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000149451↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 80332↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 20p13
- Koordináták
- 20. kromoszóma: 3 667 975–3 682 010 (GRCh38)
- Exonok
- 22 exon, összesen 14 kb
- Fehérje
- 813 aminosav
- Más néven ismert
- DKFZp434K0521, dJ964F7.1
- Korábbi jelölések
- C20orf153
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000356518.7NM_025220.5
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/adam33.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a ADAM33-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ADAM33 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.
A ADAM33 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 14 kb-jából 3,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2442 bázis kódolja a fehérjét.
ADAM33 szekvenálása
5Könnyű
Mennyire nehéz a ADAM33 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A ADAM33 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a ADAM33 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 15%.3,1%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.50%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 10%.0%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a ADAM33 exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). ADAM33 gén: ADAM metallopeptidase domain 33. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/adam33
Dante Labs. ADAM33 gén: ADAM metallopeptidase domain 33 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/adam33
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt