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Gène

TRIM38

tripartite motif containing 38

Résumé

Localisation cytogénétique
6p22.2
Coordonnées
Chromosome 6 : 25 962 802–25 991 231 (GRCh38)
Exons
8 exons sur 28,4 kb
Protéine
465 acides aminés
Aussi appelé
RORET
Symboles précédents
RNF15
Transcrit MANE Select
ENST00000357085.5NM_006355.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TRIM38. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TRIM38

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de TRIM38. TRIM38 et 48 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 25 477 017 à 26 477 016.Chromosome 66p22.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2725,6 Mb25,8 Mb26 Mb26,2 Mb26,4 MbCARMIL1 : 25 279 062–25 620 537, brin directCARMIL1SCGN : 25 652 201–25 701 792, brin directSCGN : 25 652 210–25 738 044, brin directH2AC1 : 25 723 397–25 726 562, brin inverseH2AC1H2BC1 : 25 726 777–25 727 345, brin directH2BC1SLC17A4 : 25 753 300–25 783 316, brin directSLC17A4SLC17A1 : 25 781 532–25 832 067, brin inverseSLC17A1SLC17A3 : 25 833 066–25 882 478, brin inverseSLC17A3SLC17A2 : 25 906 892–25 930 815, brin inverseSLC17A2TRIM38 : 25 962 802–25 991 231, brin directTRIM38H1-1 : 26 017 032–26 017 787, brin inverseH1-1H3C1 : 26 020 451–26 021 487, brin directH3C1H4C1 : 26 021 649–26 022 847, brin directH4C1H4C2 : 26 025 802–26 027 283, brin inverseH3C2 : 26 028 850–26 032 102, brin inverseH2AC4 : 26 033 092–26 033 618, brin inverseH2BC3 : 26 042 771–26 043 713, brin inverseH3C3 : 26 045 384–26 045 869, brin directH1-2 : 26 054 760–26 056 470, brin inverseH2BC4 : 26 067 392–26 124 016, brin inverseH2BC4HFE : 26 087 226–26 098 343, brin directHFEH4C3 : 26 103 933–26 104 337, brin directH4C3H1-6 : 26 107 412–26 108 135, brin inverseH1-6H2AC6 : 26 124 145–26 139 116, brin directH1-4 : 26 156 329–26 157 115, brin directH1-4H2BC5 : 26 158 122–26 171 349, brin directH2BC5H2BC6 : 26 172 059–26 184 655, brin directH2BC6H4C4 : 26 188 710–26 189 112, brin inverseH4C4H3C4 : 26 195 164–26 197 286, brin inverse : 26 195 595–26 199 293, brin inverseH2AC7 : 26 198 784–26 199 293, brin inverseH2BC7 : 26 199 516–26 199 988, brin directH4C5 : 26 204 610–26 205 021, brin directH2BC8 : 26 214 570–26 217 252, brin inverseH2AC8 : 26 216 921–26 218 515, brin directH3C6 : 26 224 179–26 227 476, brin directH1-3 : 26 234 212–26 234 987, brin inverseH1-3H4C6 : 26 240 393–26 240 793, brin directH4C6H4C7 : 26 246 611–26 246 996, brin inverseH4C7H3C7 : 26 250 142–26 250 635, brin inverseH2BC9 : 26 251 614–26 252 075, brin directH3C8 : 26 270 918–26 271 413, brin inverseH2BC10 : 26 272 931–26 273 412, brin directH4C8 : 26 277 609–26 285 638, brin inverseH4C8BTN3A2 : 26 365 159–26 382 797, brin directBTN3A2BTN2A2 : 26 383 091–26 394 880, brin directBTN2A2BTN3A1 : 26 402 237–26 415 216, brin directBTN3A1BTN3A3 : 26 440 452–26 453 422, brin directBTN3A3BTN2A1 : 26 457 904–26 476 621, brin directBTN2A1Schéma de TRIM38 : 8 exons sur le brin direct du chromosome 6Exon 1 : 25 962 802–25 962 855, 54 basesExon 2 : 25 963 049–25 963 282, 234 basesExon 3 : 25 966 335–25 966 933, 599 basesExon 4 : 25 969 325–25 969 420, 96 basesExon 5 : 25 971 869–25 972 099, 231 basesExon 6 : 25 973 054–25 973 076, 23 basesExon 7 : 25 973 173–25 973 285, 113 basesExon 8 : 25 983 164–25 991 231, 8 068 bases1585′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 9,4 kb sur les 28,4 kb du gène ; 1 398 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TRIM38 : tripartite motif containing 38. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trim38

Vancouver

Dante Labs. Gène TRIM38 : tripartite motif containing 38 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trim38

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