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Gène

TM4SF19

transmembrane 4 L six family member 19

Résumé

Localisation cytogénétique
3q29
Coordonnées
Chromosome 3 : 196 323 547–196 338 388 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 14,8 kb
Protéine
209 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000273695.4NM_138461.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TM4SF19. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TM4SF19

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de TM4SF19. TM4SF19 et 18 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 195 830 968 à 196 830 967.Chromosome 33q29p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29196 Mb196,2 Mb196,4 Mb196,6 Mb196,8 MbTNK2 : 195 863 364–195 911 945, brin inverseTNK2 : 195 908 695–195 909 561, brin inverseTFRC : 196 012 511–196 082 162, brin inverseTFRCZDHHC19 : 196 197 452–196 211 437, brin inverseZDHHC19SLC51A : 196 211 487–196 244 766, brin directSLC51APCYT1A : 196 214 222–196 287 957, brin inversePCYT1A : 196 248 230–196 318 222, brin inverseDYNLT2B : 196 291 219–196 318 328, brin inverseDYNLT2BTM4SF19-DYNLT2B : 196 316 082–196 338 373, brin inverseTM4SF19-DYNLT2BTM4SF19 : 196 323 547–196 338 388, brin inverseTM4SF19UBXN7 : 196 347 659–196 432 476, brin inverseUBXN7RNF168 : 196 468 783–196 503 824, brin inverseRNF168SMCO1 : 196 506 877–196 515 368, brin inverseSMCO1WDR53 : 196 552 217–196 569 263, brin inverseWDR53FBXO45 : 196 568 611–196 589 059, brin directFBXO45NRROS : 196 639 676–196 707 522, brin directNRROSPIGX : 196 639 775–196 736 016, brin directPIGXCEP19 : 196 706 268–196 712 603, brin inverseCEP19PAK2 : 196 739 743–196 832 647, brin directPAK2Schéma de TM4SF19 : 5 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 5 : 196 323 547–196 323 997, 451 basesExon 4 : 196 324 271–196 324 440, 170 basesExon 3 : 196 326 955–196 327 032, 78 basesExon 2 : 196 327 390–196 327 591, 202 basesExon 1 : 196 338 264–196 338 388, 125 bases543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1 kb sur les 14,8 kb du gène ; 630 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de TM4SF19

0Facile

Difficulté de séquençage de TM4SF19 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de TM4SF19 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de TM4SF19 dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Couverture de référence0 %
  • Répétitions0,6 %
  • Teneur en GC0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TM4SF19 : transmembrane 4 L six family member 19. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tm4sf19

Vancouver

Dante Labs. Gène TM4SF19 : transmembrane 4 L six family member 19 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tm4sf19

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