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Gène

SRPRA

SRP receptor subunit alpha

Résumé

Localisation cytogénétique
11q24.2
Coordonnées
Chromosome 11 : 126 262 938–126 268 895 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 6 kb
Protéine
638 acides aminés
Aussi appelé
SRP-alpha, Sralpha, SR-alpha
Symboles précédents
SRPR
Transcrit MANE Select
ENST00000332118.11NM_003139.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SRPRA. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SRPRA

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de SRPRA. SRPRA et 15 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 125 765 917 à 126 765 916.Chromosome 1111q24.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25125,8 Mb126 Mb126,2 Mb126,4 Mb126,6 MbPATE2 : 125 776 113–125 778 828, brin inversePATE2PATE3 : 125 788 127–125 791 600, brin directPATE3PATE4 : 125 833 316–125 840 072, brin directPATE4HYLS1 : 125 883 614–125 900 846, brin directHYLS1PUS3 : 125 892 347–125 903 227, brin inversePUS3DDX25 : 125 903 348–125 943 702, brin directDDX25VSIG10L2 : 125 946 044–125 958 647, brin directVSIG10L2CDON : 125 955 796–126 063 335, brin inverseCDONRPUSD4 : 126 201 792–126 211 692, brin inverseRPUSD4SIRAL1 : 126 211 687–126 265 162, brin directSIRAL1SRPRA : 126 262 938–126 268 895, brin inverseSRPRAFOXRED1 : 126 269 024–126 281 756, brin directFOXRED1TIRAP : 126 282 497–126 298 845, brin directTIRAPDCPS : 126 303 971–126 350 005, brin directDCPSST3GAL4 : 126 354 677–126 442 293, brin directST3GAL4KIRREL3 : 126 423 358–127 003 460, brin inverseKIRREL3Schéma de SRPRA : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 11Exon 14 : 126 262 938–126 264 044, 1 107 basesExon 13 : 126 264 191–126 264 289, 99 basesExon 12 : 126 264 376–126 264 539, 164 basesExon 11 : 126 264 959–126 265 172, 214 basesExon 10 : 126 265 268–126 265 440, 173 basesExon 9 : 126 265 737–126 265 823, 87 basesExon 8 : 126 265 963–126 266 081, 119 basesExon 7 : 126 266 187–126 266 278, 92 basesExon 6 : 126 266 476–126 266 629, 154 basesExon 5 : 126 266 763–126 266 922, 160 basesExon 4 : 126 267 175–126 267 335, 161 basesExon 3 : 126 267 549–126 267 712, 164 basesExon 2 : 126 268 003–126 268 086, 84 basesExon 1 : 126 268 688–126 268 895, 208 bases14131211109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3 kb sur les 6 kb du gène ; 1 917 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SRPRA

1Facile

Difficulté de séquençage de SRPRA avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de SRPRA se situent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Facteur aggravant : la part des exons de SRPRA située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions2,1 %
  • Teneur en GC4,7 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SRPRA : SRP receptor subunit alpha. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/srpra

Vancouver

Dante Labs. Gène SRPRA : SRP receptor subunit alpha [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/srpra

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