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Gène

SOX30

SRY-box transcription factor 30

Résumé

Localisation cytogénétique
5q33.3
Coordonnées
Chromosome 5 : 157 625 679–157 652 438 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 26,8 kb
Protéine
753 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000265007.11NM_178424.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SOX30. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SOX30

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de SOX30. SOX30 et 13 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 157 139 059 à 158 139 058.Chromosome 55q33.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3157,2 Mb157,4 Mb157,6 Mb157,8 Mb158 MbHAVCR2 : 157 085 422–157 142 869, brin inverseHAVCR2MED7 : 157 134 848–157 159 019, brin inverseMED7ITK : 157 142 933–157 255 185, brin directITKGARIN3 : 157 161 846–157 166 264, brin inverseGARIN3CYFIP2 : 157 266 079–157 395 595, brin directCYFIP2 : 157 341 596–157 460 100, brin inverseFNDC9 : 157 341 598–157 345 766, brin inverseFNDC9ADAM19 : 157 395 534–157 575 858, brin inverseADAM19NIPAL4 : 157 460 213–157 474 723, brin directNIPAL4SOX30 : 157 625 679–157 652 438, brin inverseSOX30C5orf52 : 157 671 515–157 680 174, brin directC5orf52THG1L : 157 731 402–157 741 449, brin directTHG1LLSM11 : 157 743 706–157 760 709, brin directLSM11CLINT1 : 157 783 121–157 859 206, brin inverseCLINT1Schéma de SOX30 : 5 exons sur le brin inverse du chromosome 5Exon 5 : 157 625 679–157 626 721, 1 043 basesExon 4 : 157 638 230–157 638 722, 493 basesExon 3 : 157 646 637–157 646 816, 180 basesExon 2 : 157 648 657–157 648 896, 240 basesExon 1 : 157 651 112–157 652 438, 1 327 bases543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,3 kb sur les 26,8 kb du gène ; 2 262 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SOX30 : SRY-box transcription factor 30. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sox30

Vancouver

Dante Labs. Gène SOX30 : SRY-box transcription factor 30 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sox30

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