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Gène

SMTNL1

smoothelin like 1

Résumé

Localisation cytogénétique
11q12.1
Coordonnées
Chromosome 11 : 57 537 595–57 550 272 (GRCh38)
Exons
8 exons sur 12,7 kb
Protéine
494 acides aminés
Aussi appelé
CHASM
Transcrit MANE Select
ENST00000527972.6NM_001105565.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SMTNL1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SMTNL1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de SMTNL1. SMTNL1 et 26 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 57 043 934 à 58 043 933.Chromosome 1111q12.1p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2557,2 Mb57,4 Mb57,6 Mb57,8 Mb58 MbLRRC55 : 57 181 747–57 191 717, brin directLRRC55APLNR : 57 233 577–57 237 250, brin inverseAPLNRCNOT12 : 57 299 588–57 325 682, brin inverseCNOT12SSRP1 : 57 325 982–57 335 952, brin inverseSSRP1P2RX3 : 57 338 346–57 374 566, brin directP2RX3PRG3 : 57 376 769–57 381 150, brin inversePRG3PRG2 : 57 386 780–57 393 854, brin inversePRG2 : 57 387 365–57 424 059, brin inverseSLC43A3 : 57 406 954–57 457 505, brin inverseSLC43A3RTN4RL2 : 57 460 484–57 477 534, brin directRTN4RL2SLC43A1 : 57 484 064–57 515 780, brin inverseSLC43A1TIMM10 : 57 524 761–57 531 031, brin inverseTIMM10SMTNL1 : 57 537 595–57 550 272, brin directSMTNL1UBE2L6 : 57 551 656–57 568 284, brin inverseUBE2L6SERPING1 : 57 597 387–57 619 246, brin directSERPING1CLP1 : 57 638 605–57 662 755, brin directCLP1YPEL4 : 57 645 087–57 649 944, brin inverseYPEL4ZDHHC5 : 57 667 433–57 702 260, brin directZDHHC5MED19 : 57 703 710–57 712 348, brin inverseMED19TMX2 : 57 712 365–57 742 987, brin directTMX2 : 57 712 582–57 818 431, brin directSELENOH : 57 741 491–57 743 554, brin directSELENOH : 57 741 779–57 804 771, brin directBTBD18 : 57 743 514–57 753 148, brin inverseBTBD18CTNND1 : 57 753 243–57 819 546, brin directOR9Q1 : 58 023 881–58 181 616, brin directOR9Q1OR6Q1 : 58 030 953–58 031 906, brin directOR6Q1Schéma de SMTNL1 : 8 exons sur le brin direct du chromosome 11Exon 1 : 57 537 595–57 537 642, 48 basesExon 2 : 57 542 641–57 543 374, 734 basesExon 3 : 57 543 624–57 543 756, 133 basesExon 4 : 57 543 869–57 543 920, 52 basesExon 5 : 57 545 881–57 546 036, 156 basesExon 6 : 57 546 233–57 546 347, 115 basesExon 7 : 57 546 501–57 546 652, 152 basesExon 8 : 57 549 968–57 550 272, 305 bases123456785′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,7 kb sur les 12,7 kb du gène ; 1 485 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SMTNL1 : smoothelin like 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/smtnl1

Vancouver

Dante Labs. Gène SMTNL1 : smoothelin like 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/smtnl1

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