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Gène

RPL7L1

ribosomal protein L7 like 1

Résumé

Localisation cytogénétique
6p21.1
Coordonnées
Chromosome 6 : 42 879 616–42 889 900 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 10,3 kb
Protéine
255 acides aminés
Aussi appelé
dJ475N16.4
Transcrit MANE Select
ENST00000493763.7NM_001366481.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RPL7L1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RPL7L1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de RPL7L1. RPL7L1 et 26 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 42 384 758 à 43 384 757.Chromosome 66p21.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2742,4 Mb42,6 Mb42,8 Mb43 Mb43,2 MbTRERF1 : 42 224 931–42 452 225, brin inverseTRERF1UBR2 : 42 563 969–42 693 505, brin directUBR2PRPH2 : 42 696 598–42 722 621, brin inversePRPH2TBCC : 42 744 498–42 746 103, brin inverseTBCCBICRAL : 42 781 931–42 868 560, brin directBICRALRPL7L1 : 42 879 616–42 889 900, brin directRPL7L1PEX39 : 42 890 265–42 890 821, brin inversePEX39PTCRA : 42 915 989–42 925 845, brin directPTCRACNPY3 : 42 928 975–42 940 217, brin directCNPY3PEX6 : 42 959 717–42 979 249, brin inversePEX6GNMT : 42 960 268–42 970 699, brin directGNMTPPP2R5D : 42 984 533–43 012 346, brin directPPP2R5DMEA1 : 43 011 143–43 016 868, brin inverseMEA1KLHDC3 : 43 014 103–43 021 314, brin directKLHDC3RRP36 : 43 021 588–43 034 156, brin directRRP36CUL7 : 43 037 617–43 053 943, brin inverseKLC4 : 43 040 777–43 075 099, brin direct : 43 051 066–43 058 185, brin inverseMRPL2 : 43 054 029–43 059 464, brin inversePTK7 : 43 076 256–43 161 719, brin directPTK7SRF : 43 170 910–43 181 506, brin directSRFCUL9 : 43 182 166–43 224 587, brin directCUL9DNPH1 : 43 225 629–43 229 490, brin inverseDNPH1TTBK1 : 43 243 481–43 288 258, brin directTTBK1SLC22A7 : 43 295 694–43 305 543, brin directSLC22A7CRIP3 : 43 299 710–43 308 878, brin inverseCRIP3ZNF318 : 43 307 134–43 369 687, brin inverseZNF318Schéma de RPL7L1 : 6 exons sur le brin direct du chromosome 6Exon 1 : 42 879 616–42 879 951, 336 basesExon 2 : 42 880 861–42 880 966, 106 basesExon 3 : 42 883 451–42 883 614, 164 basesExon 4 : 42 884 613–42 884 750, 138 basesExon 5 : 42 885 974–42 886 083, 110 basesExon 6 : 42 886 256–42 889 900, 3 645 bases1234565′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,5 kb sur les 10,3 kb du gène ; 768 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de RPL7L1

74Difficile

Difficulté de séquençage de RPL7L1 avec des lectures courtes, sur 100

Une grande partie de RPL7L1 se situe dans des zones où les lectures courtes peuvent manquer une variation ou la mal placer.

Facteur aggravant : la part des exons de RPL7L1 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité47 %
  • Homologie83 %
  • Partagé avec le chrY0 %
  • Couverture de la référence0 %
  • Répétitions1,8 %
  • Teneur en GC0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RPL7L1 : ribosomal protein L7 like 1. Consulté le 20 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rpl7l1

Vancouver

Dante Labs. Gène RPL7L1 : ribosomal protein L7 like 1 [Internet]. [consulté le 20 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rpl7l1

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