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Gène

RBM39

RNA binding motif protein 39

Résumé

Localisation cytogénétique
20q11.22
Coordonnées
Chromosome 20 : 35 701 347–35 742 260 (GRCh38)
Exons
17 exons sur 40,9 kb
Protéine
530 acides aminés
Aussi appelé
CC1.3, HCC1, CAPER, fSAP59, CAPERalpha
Symboles précédents
RNPC2
Transcrit MANE Select
ENST00000253363.11NM_184234.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RBM39. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RBM39

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de RBM39. RBM39 et 20 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 35 221 804 à 36 221 803.Chromosome 2020q11.22p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3335,4 Mb35,6 Mb35,8 Mb36 Mb36,2 MbMMP24OS : 35 201 745–35 278 131, brin inverseMMP24 : 35 226 559–35 277 030, brin directMMP24 : 35 267 885–35 280 043, brin inverseEIF6 : 35 278 891–35 285 009, brin inverseEIF6SACK1C : 35 285 731–35 292 425, brin inverseSACK1CUQCC1 : 35 301 219–35 412 070, brin inverseUQCC1GDF5 : 35 433 347–35 454 754, brin inverseGDF5CEP250 : 35 455 131–35 519 280, brin directCEP250C20orf173 : 35 523 186–35 529 652, brin inverseC20orf173ERGIC3 : 35 542 022–35 557 634, brin directERGIC3SPAG4 : 35 615 594–35 621 613, brin directSPAG4CPNE1 : 35 626 031–35 664 962, brin inverseCPNE1 : 35 632 340–35 674 544, brin inverseRBM12 : 35 648 925–35 664 956, brin inverseRBM12NFS1 : 35 668 052–35 699 376, brin inverseNFS1ROMO1 : 35 699 228–35 703 939, brin directROMO1RBM39 : 35 701 347–35 742 260, brin inverseRBM39PHF20 : 35 771 947–35 950 385, brin directPHF20SCAND1 : 35 953 617–35 959 472, brin inverseSCAND1CNBD2 : 35 954 564–36 030 700, brin directCNBD2EPB41L1 : 36 091 504–36 232 799, brin directEPB41L1Schéma de RBM39 : 17 exons sur le brin inverse du chromosome 20Exon 17 : 35 701 347–35 704 581, 3 235 basesExon 16 : 35 704 668–35 704 746, 79 basesExon 15 : 35 705 225–35 705 330, 106 basesExon 14 : 35 707 120–35 707 201, 82 basesExon 13 : 35 709 224–35 709 274, 51 basesExon 12 : 35 713 019–35 713 096, 78 basesExon 11 : 35 714 185–35 714 389, 205 basesExon 10 : 35 716 740–35 716 805, 66 basesExon 9 : 35 721 740–35 721 877, 138 basesExon 8 : 35 724 570–35 724 722, 153 basesExon 7 : 35 725 038–35 725 155, 118 basesExon 6 : 35 729 312–35 729 365, 54 basesExon 5 : 35 729 462–35 729 527, 66 basesExon 4 : 35 731 941–35 732 135, 195 basesExon 3 : 35 738 968–35 739 017, 50 basesExon 2 : 35 740 824–35 740 887, 64 basesExon 1 : 35 741 941–35 742 260, 320 bases1716141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,1 kb sur les 40,9 kb du gène ; 1 593 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RBM39 : RNA binding motif protein 39. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rbm39

Vancouver

Dante Labs. Gène RBM39 : RNA binding motif protein 39 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rbm39

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