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Gène

PTPN1

protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1

Résumé

Localisation cytogénétique
20q13.13
Coordonnées
Chromosome 20 : 50 510 383–50 585 241 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 74,9 kb
Protéine
435 acides aminés
Symboles précédents
PTP1B
Transcrit MANE Select
ENST00000371621.5NM_002827.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PTPN1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PTPN1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de PTPN1. PTPN1 et 11 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 50 047 812 à 51 047 811.Chromosome 2020q13.13p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3350,2 Mb50,4 Mb50,6 Mb50,8 Mb51 MbUBE2V1 : 50 081 122–50 115 959, brin inverseUBE2V1PEDS1-UBE2V1 : 50 081 124–50 153 637, brin inversePEDS1-UBE2V1PEDS1 : 50 118 254–50 153 754, brin inversePEDS1CEBPB : 50 190 734–50 192 690, brin directCEBPBPTPN1 : 50 510 383–50 585 241, brin directPTPN1RIPOR3 : 50 585 180–50 692 021, brin inverseRIPOR3PARD6B : 50 731 365–50 756 836, brin directPARD6BBCAS4 : 50 794 894–50 877 179, brin directBCAS4ADNP : 50 854 048–50 931 437, brin inverseADNPDPM1 : 50 932 897–50 959 145, brin inverseDPM1MOCS3 : 50 958 818–50 963 929, brin directMOCS3KCNG1 : 51 003 655–51 023 244, brin inverseKCNG1Schéma de PTPN1 : 10 exons sur le brin direct du chromosome 20Exon 1 : 50 510 383–50 510 590, 208 basesExon 2 : 50 561 363–50 561 453, 91 basesExon 3 : 50 564 969–50 565 069, 101 basesExon 4 : 50 568 380–50 568 478, 99 basesExon 5 : 50 574 517–50 574 654, 138 basesExon 6 : 50 578 420–50 578 629, 210 basesExon 7 : 50 579 168–50 579 329, 162 basesExon 8 : 50 579 703–50 579 926, 224 basesExon 9 : 50 581 265–50 581 460, 196 basesExon 10 : 50 582 692–50 585 241, 2 550 bases12468105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4 kb sur les 74,9 kb du gène ; 1 308 de ces bases codent pour la protéine.

Traits associés à PTPN1

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que PTPN1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PTPN1 : protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptpn1

Vancouver

Dante Labs. Gène PTPN1 : protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptpn1

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