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Gène

KRTAP5-2

keratin associated protein 5-2

Résumé

Localisation cytogénétique
11p15.5
Coordonnées
Chromosome 11 : 1 597 177–1 598 294 (GRCh38)
Exons
1 exon sur 1,1 kb
Protéine
177 acides aminés
Aussi appelé
KRTAP5.2, KRTAP5-8
Transcrit MANE Select
ENST00000412090.2NM_001004325.2
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore KRTAP5-2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de KRTAP5-2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de KRTAP5-2. KRTAP5-2 et 22 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 1 097 736 à 2 097 735.Chromosome 1111p15.5p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q251,2 Mb1,4 Mb1,6 Mb1,8 Mb2 MbMUC2 : 1 074 875–1 110 511, brin directMUC2MUC5AC : 1 157 953–1 201 138, brin directMUC5ACMUC5B : 1 223 066–1 262 172, brin directMUC5BTOLLIP : 1 264 771–1 310 258, brin inverseTOLLIPBRSK2 : 1 389 899–1 462 689, brin directBRSK2MOB2 : 1 469 457–1 501 247, brin inverseMOB2DUSP8 : 1 554 051–1 573 076, brin inverseKRTAP5-1 : 1 584 342–1 585 283, brin inverseKRTAP5-1KRTAP5-2 : 1 597 177–1 598 294, brin inverseKRTAP5-2KRTAP5-3 : 1 607 565–1 608 463, brin inverseKRTAP5-3KRTAP5-4 : 1 620 958–1 622 138, brin inverseKRTAP5-4KRTAP5-5 : 1 629 775–1 630 930, brin directKRTAP5-6 : 1 697 195–1 697 755, brin directKRTAP5-6IFITM10 : 1 732 406–1 750 607, brin inverseIFITM10 : 1 734 821–1 763 954, brin inverseCTSD : 1 752 752–1 764 573, brin inverseCTSDSYT8 : 1 828 307–1 837 521, brin directSYT8TNNI2 : 1 838 971–1 841 680, brin directTNNI2LSP1 : 1 850 904–1 892 267, brin directLSP1PRR33 : 1 888 078–1 917 713, brin inversePRR33TNNT3 : 1 919 456–1 938 711, brin directTNNT3MRPL23 : 1 947 278–2 014 943, brin directMRPL23H19 : 1 995 165–2 004 552, brin inverseH19Schéma de KRTAP5-2 : un exon sur le brin inverse du chromosome 11Exon 1 : 1 597 177–1 598 294, 1 118 bases15′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,1 kb sur les 1,1 kb du gène ; 534 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de KRTAP5-2

41Élevée

Difficulté de séquençage de KRTAP5-2 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0,9 %
  • Homologie100 %
  • Répétitions45 %
  • Teneur en GC37 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène KRTAP5-2 : keratin associated protein 5-2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/krtap5-2

Vancouver

Dante Labs. Gène KRTAP5-2 : keratin associated protein 5-2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/krtap5-2

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