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Gène

HCLS1

hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1

Résumé

Localisation cytogénétique
3q13.33
Coordonnées
Chromosome 3 : 121 631 399–121 660 903 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 29,5 kb
Protéine
486 acides aminés
Aussi appelé
HS1, CTTNL
Transcrit MANE Select
ENST00000314583.8NM_005335.6
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HCLS1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HCLS1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de HCLS1. HCLS1 et 10 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 121 146 151 à 122 146 150.Chromosome 33q13.33p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29121,2 Mb121,4 Mb121,6 Mb121,8 Mb122 MbSTXBP5L : 120 908 072–121 424 761, brin directSTXBP5LPOLQ : 121 431 419–121 546 007, brin inversePOLQARGFX : 121 567 949–121 590 622, brin directARGFXFBXO40 : 121 592 886–121 630 434, brin directFBXO40HCLS1 : 121 631 399–121 660 903, brin inverseHCLS1GOLGB1 : 121 663 189–121 749 966, brin inverseGOLGB1IQCB1 : 121 769 398–121 835 093, brin inverseIQCB1EAF2 : 121 835 164–121 888 073, brin directEAF2SLC15A2 : 121 894 355–121 944 188, brin directSLC15A2ILDR1 : 121 987 322–122 022 282, brin inverseILDR1CD86 : 122 055 356–122 121 557, brin directCD86Schéma de HCLS1 : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 14 : 121 631 399–121 631 982, 584 basesExon 13 : 121 632 101–121 632 184, 84 basesExon 12 : 121 632 332–121 632 563, 232 basesExon 11 : 121 633 067–121 633 171, 105 basesExon 10 : 121 634 207–121 634 418, 212 basesExon 9 : 121 635 735–121 635 804, 70 basesExon 8 : 121 636 434–121 636 489, 56 basesExon 7 : 121 637 146–121 637 256, 111 basesExon 6 : 121 642 927–121 642 981, 55 basesExon 5 : 121 644 818–121 644 928, 111 basesExon 4 : 121 647 319–121 647 448, 130 basesExon 3 : 121 657 279–121 657 352, 74 basesExon 2 : 121 658 264–121 658 347, 84 basesExon 1 : 121 660 820–121 660 903, 84 bases141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2 kb sur les 29,5 kb du gène ; 1 461 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène HCLS1 : hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hcls1

Vancouver

Dante Labs. Gène HCLS1 : hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hcls1

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