Gen

HCLS1

hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1

Cytogenetisk plassering: 3q13.33
Koordinater: Kromosom 3: 121 631 399–121 660 903 (GRCh38)
Eksoner: 14 eksoner over 29,5 kb
Protein: 486 aminosyrer
Også kjent som: HS1, CTTNL
MANE Select-transkripsjon: ENST00000314583.8NM_005335.6
Lokustype: Proteinkodende

Svært høy
Sikker
Lav
Svært lav

Denne siden som data

Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.

library(jsonlite)

url <- "https://dantelabs.com/genes/hcls1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$name

Åpne JSON

Les HCLS1 og resten av genomet ditt med én test.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser HCLS1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er HCLS1 bygget opp

Kodende sekvens
Utranslatert region
Intron
Transkripsjonsretning
Områder som korte avlesninger sliter med

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 2 kb av genets 29,5 kb, og 1 461 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av HCLS1

2Lett

Hvor vanskelig HCLS1 er å sekvensere med korte leser, av 100

Nesten alle eksonene til HCLS1 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til HCLS1 i hver type vanskelig område

Kartleggbarhet0 %
Homologi0 %
Delt med chrY0 %
Referansedekning0 %
Repetisjoner6,1 %
GC-innhold0 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Genposter

Transkripsjon

Protein

Varianter

Klinisk

Her kommer dette fra

HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). HCLS1-genet: hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hcls1

Vancouver

Dante Labs. HCLS1-genet: hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hcls1

Én test. En livstid med svar.