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Gène

GADD45A

growth arrest and DNA damage inducible alpha

Résumé

Localisation cytogénétique
1p31.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 67 685 201–67 688 334 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 3,1 kb
Protéine
165 acides aminés
Aussi appelé
GADD45
Symboles précédents
DDIT1
Transcrit MANE Select
ENST00000370986.9NM_001924.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GADD45A. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GADD45A

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de GADD45A. GADD45A et 7 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 67 186 768 à 68 186 767.Chromosome 11p31.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4467,2 Mb67,4 Mb67,6 Mb67,8 Mb68 MbC1orf141 : 67 092 005–67 231 853, brin inverseC1orf141IL23R : 67 138 907–67 265 873, brin directIL23RIL12RB2 : 67 307 364–67 398 724, brin directIL12RB2SERBP1 : 67 406 389–67 430 418, brin inverseSERBP1GADD45A : 67 685 201–67 688 334, brin directGADD45AGNG12 : 67 701 461–67 833 811, brin inverseGNG12DIRAS3 : 68 045 513–68 051 717, brin inverseDIRAS3WLS : 68 095 398–68 233 120, brin inverseWLSSchéma de GADD45A : 4 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 67 685 201–67 685 538, 338 basesExon 2 : 67 686 025–67 686 126, 102 basesExon 3 : 67 686 350–67 686 587, 238 basesExon 4 : 67 687 661–67 688 334, 674 bases12345′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,4 kb sur les 3,1 kb du gène ; 498 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de GADD45A

7Facile

Difficulté de séquençage de GADD45A avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de GADD45A se situent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Facteur aggravant : la part des exons de GADD45A située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0,2 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions2,6 %
  • Teneur en GC64 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène GADD45A : growth arrest and DNA damage inducible alpha. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/gadd45a

Vancouver

Dante Labs. Gène GADD45A : growth arrest and DNA damage inducible alpha [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/gadd45a

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