Gen
GADD45A
growth arrest and DNA damage inducible alpha
- HGNC 4095↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000116717↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 1647↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 1p31.3
- Koordinater
- Kromosom 1: 67 685 201–67 688 334 (GRCh38)
- Exoner
- 4 exoner på 3,1 kb
- Protein
- 165 aminosyror
- Även känd som
- GADD45
- Tidigare symboler
- DDIT1
- MANE Select-transkript
- ENST00000370986.9NM_001924.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gadd45a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs GADD45A, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser GADD45A ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är GADD45A uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,4 kb av genens 3,1 kb, och 498 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av GADD45A
7Lätt
Hur svår GADD45A är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i GADD45A ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av GADD45A:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0,2 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 15 %.2,6 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 10 %.64 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av GADD45A:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). GADD45A-genen: growth arrest and DNA damage inducible alpha. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gadd45a
Dante Labs. GADD45A-genen: growth arrest and DNA damage inducible alpha [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gadd45a
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor