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Gène

BLACAT1

BLACAT1 overlapping LEMD1 locus

Résumé

Localisation cytogénétique
1q32.1
Coordonnées
Chromosome 1 : 205 434 886–205 456 045 (GRCh38)
Exons
2 exons sur 21,2 kb
Protéine
33 acides aminés
Aussi appelé
linc-UBC1, LINC00912, onco-lncRNA-30
Transcrit MANE Select
ENST00000629624.3NM_001397426.2
Type de locus
gene with protein product

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de BLACAT1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de BLACAT1. BLACAT1 et 18 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 204 945 466 à 205 945 465.Chromosome 11q32.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44205 Mb205,2 Mb205,4 Mb205,6 Mb205,8 MbNFASC : 204 828 651–205 022 822, brin directNFASCCNTN2 : 205 042 937–205 078 289, brin directCNTN2TMEM81 : 205 083 129–205 084 460, brin inverseTMEM81RBBP5 : 205 085 685–205 122 263, brin inverseRBBP5DSTYK : 205 142 505–205 211 741, brin inverseDSTYKTMCC2 : 205 227 912–205 285 632, brin directTMCC2NUAK2 : 205 302 059–205 321 781, brin inverseNUAK2KLHDC8A : 205 333 749–205 357 324, brin inverseKLHDC8ALEMD1 : 205 381 376–205 456 415, brin inverseLEMD1BLACAT1 : 205 434 886–205 456 045, brin inverseBLACAT1CDK18 : 205 504 551–205 532 976, brin directCDK18SLC60A1 : 205 568 833–205 602 918, brin directSLC60A1ELK4 : 205 597 374–205 634 520, brin inverseELK4SLC45A3 : 205 657 851–205 680 990, brin inverseSLC45A3NUCKS1 : 205 710 543–205 750 270, brin inverseNUCKS1RAB29 : 205 767 986–205 775 489, brin inverseRAB29SLC41A1 : 205 789 091–205 813 767, brin inverseSLC41A1PM20D1 : 205 825 657–205 850 133, brin inversePM20D1SLC26A9 : 205 913 048–205 943 460, brin inverseSLC26A9Schéma de BLACAT1 : 2 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 2 : 205 434 886–205 441 062, 6 177 basesExon 1 : 205 455 917–205 456 045, 129 bases215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6,3 kb sur les 21,2 kb du gène ; 102 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène BLACAT1 : BLACAT1 overlapping LEMD1 locus. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/blacat1

Vancouver

Dante Labs. Gène BLACAT1 : BLACAT1 overlapping LEMD1 locus [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/blacat1

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