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Gène

ATP5PB

ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b

Résumé

Localisation cytogénétique
1p13.2
Coordonnées
Chromosome 1 : 111 449 464–111 462 773 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 13,3 kb
Protéine
256 acides aminés
Symboles précédents
ATP5F1
Transcrit MANE Select
ENST00000369722.8NM_001688.5
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ATP5PB. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ATP5PB

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de ATP5PB. ATP5PB et 16 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 110 956 119 à 111 956 118.Chromosome 11p13.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44111 Mb111,2 Mb111,4 Mb111,6 Mb111,8 MbLRIF1 : 110 946 289–110 964 093, brin inverseLRIF1DRAM2 : 111 114 206–111 140 225, brin inverseDRAM2CEPT1 : 111 139 418–111 187 179, brin directCEPT1DENND2D : 111 183 876–111 204 535, brin inverseDENND2DCHI3L2 : 111 200 771–111 243 440, brin directCHI3L2CHIA : 111 290 851–111 320 566, brin directCHIACIMAP3 : 111 346 269–111 355 113, brin directCIMAP3OVGP1 : 111 413 379–111 427 735, brin inverseOVGP1WDR77 : 111 437 222–111 449 297, brin inverseWDR77ATP5PB : 111 449 464–111 462 773, brin directATP5PBC1orf162 : 111 473 754–111 478 513, brin directC1orf162TMIGD3 : 111 480 668–111 563 962, brin inverseTMIGD3ADORA3 : 111 499 429–111 503 854, brin inverseADORA3RAP1A : 111 542 009–111 716 691, brin directRAP1AINKA2 : 111 680 223–111 755 824, brin inverseINKA2DDX20 : 111 754 832–111 775 602, brin directDDX20KCND3 : 111 770 662–111 990 131, brin inverseKCND3Schéma de ATP5PB : 7 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 111 449 464–111 449 581, 118 basesExon 2 : 111 449 837–111 449 873, 37 basesExon 3 : 111 454 211–111 454 356, 146 basesExon 4 : 111 456 086–111 456 249, 164 basesExon 5 : 111 456 630–111 456 755, 126 basesExon 6 : 111 459 457–111 459 636, 180 basesExon 7 : 111 460 917–111 462 773, 1 857 bases12345675′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,6 kb sur les 13,3 kb du gène ; 771 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de ATP5PB

6Faible

Difficulté de séquençage de ATP5PB avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité12 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions2,3 %
  • Teneur en GC9,5 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ATP5PB : ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/atp5pb

Vancouver

Dante Labs. Gène ATP5PB : ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/atp5pb

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