Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ATP5PB

ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
1p13.2
Koordináták
1. kromoszóma: 111 449 464–111 462 773 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 13,3 kb
Fehérje
256 aminosav
Korábbi jelölések
ATP5F1
MANE Select transzkriptum
ENST00000369722.8NM_001688.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ATP5PB gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ATP5PB felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
1. kromoszóma, a ATP5PB helyét zárójel jelöli. A ATP5PB és környékén 16 gén a 1. kromoszómán, 110 956 119–111 956 118 között.1. kromoszóma1p13.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44111 Mb111,2 Mb111,4 Mb111,6 Mb111,8 MbLRIF1: 110 946 289–110 964 093, fordított szálLRIF1DRAM2: 111 114 206–111 140 225, fordított szálDRAM2CEPT1: 111 139 418–111 187 179, előre szálCEPT1DENND2D: 111 183 876–111 204 535, fordított szálDENND2DCHI3L2: 111 200 771–111 243 440, előre szálCHI3L2CHIA: 111 290 851–111 320 566, előre szálCHIACIMAP3: 111 346 269–111 355 113, előre szálCIMAP3OVGP1: 111 413 379–111 427 735, fordított szálOVGP1WDR77: 111 437 222–111 449 297, fordított szálWDR77ATP5PB: 111 449 464–111 462 773, előre szálATP5PBC1orf162: 111 473 754–111 478 513, előre szálC1orf162TMIGD3: 111 480 668–111 563 962, fordított szálTMIGD3ADORA3: 111 499 429–111 503 854, fordított szálADORA3RAP1A: 111 542 009–111 716 691, előre szálRAP1AINKA2: 111 680 223–111 755 824, fordított szálINKA2DDX20: 111 754 832–111 775 602, előre szálDDX20KCND3: 111 770 662–111 990 131, fordított szálKCND3A ATP5PB ábrája: 7 exon a(z) 1. kromoszóma előre szálán1. exon: 111 449 464–111 449 581, 118 bázis2. exon: 111 449 837–111 449 873, 37 bázis3. exon: 111 454 211–111 454 356, 146 bázis4. exon: 111 456 086–111 456 249, 164 bázis5. exon: 111 456 630–111 456 755, 126 bázis6. exon: 111 459 457–111 459 636, 180 bázis7. exon: 111 460 917–111 462 773, 1857 bázis12345675′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 13,3 kb-jából 2,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 771 bázis kódolja a fehérjét.

ATP5PB szekvenálása

14Könnyű

Mennyire nehéz a ATP5PB rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ATP5PB exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a ATP5PB exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség12%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,3%
  • GC-tartalom9,5%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ATP5PB gén: ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/atp5pb

Vancouver

Dante Labs. ATP5PB gén: ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/atp5pb

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet