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Gène

ATG16L1

autophagy related 16 like 1

Résumé

Localisation cytogénétique
2q37.1
Coordonnées
Chromosome 2 : 233 251 673–233 295 669 (GRCh38)
Exons
18 exons sur 44 kb
Protéine
607 acides aminés
Aussi appelé
WDR30, FLJ10035, ATG16A
Symboles précédents
APG16L, ATG16L
Transcrit MANE Select
ENST00000392017.9NM_030803.7
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ATG16L1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ATG16L1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de ATG16L1. ATG16L1 et 18 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 232 773 671 à 233 773 670.Chromosome 22q37.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3232,8 Mb233 Mb233,2 Mb233,4 Mb233,6 MbGIGYF2 : 232 697 259–232 863 338, brin directGIGYF2KCNJ13 : 232 765 802–232 776 566, brin inverseKCNJ13SNORC : 232 857 270–232 878 708, brin directSNORCNGEF : 232 878 686–233 013 263, brin inverseNGEFNEU2 : 233 023 032–233 042 480, brin directNEU2INPP5D : 233 059 967–233 207 903, brin directINPP5DATG16L1 : 233 251 673–233 295 669, brin directATG16L1SAG : 233 307 816–233 347 055, brin directSAGDGKD : 233 354 475–233 472 104, brin directDGKDUSP40 : 233 475 526–233 566 783, brin inverseUSP40UGT1A8 : 233 617 633–233 773 310, brin directUGT1A8UGT1A10 : 233 636 447–233 773 310, brin directUGT1A10UGT1A9 : 233 671 734–233 773 310, brin directUGT1A9UGT1A7 : 233 681 885–233 773 310, brin directUGT1A7UGT1A6 : 233 691 607–233 773 300, brin directUGT1A5 : 233 712 907–233 773 310, brin directUGT1A4 : 233 718 727–233 773 310, brin directUGT1A3 : 233 729 042–233 773 310, brin directUGT1A1 : 233 760 262–233 773 313, brin directSchéma de ATG16L1 : 18 exons sur le brin direct du chromosome 2Exon 1 : 233 251 673–233 251 942, 270 basesExon 2 : 233 256 102–233 256 195, 94 basesExon 3 : 233 263 130–233 263 235, 106 basesExon 4 : 233 263 992–233 264 065, 74 basesExon 5 : 233 264 892–233 265 143, 252 basesExon 6 : 233 270 002–233 270 067, 66 basesExon 7 : 233 272 966–233 273 052, 87 basesExon 8 : 233 273 721–233 273 777, 57 basesExon 9 : 233 274 676–233 274 778, 103 basesExon 10 : 233 277 568–233 277 673, 106 basesExon 11 : 233 281 105–233 281 175, 71 basesExon 12 : 233 282 682–233 282 753, 72 basesExon 13 : 233 289 854–233 289 974, 121 basesExon 14 : 233 290 248–233 290 353, 106 basesExon 15 : 233 292 128–233 292 277, 150 basesExon 16 : 233 292 387–233 292 434, 48 basesExon 17 : 233 293 256–233 293 357, 102 basesExon 18 : 233 294 257–233 295 669, 1 413 bases1246810121416185′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,3 kb sur les 44 kb du gène ; 1 824 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ATG16L1 : autophagy related 16 like 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/atg16l1

Vancouver

Dante Labs. Gène ATG16L1 : autophagy related 16 like 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/atg16l1

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