Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

ZBTB38

zinc finger and BTB domain containing 38

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
3q23
Koordinaatit
Kromosomi 3: 141 368 504–141 449 792 (GRCh38)
Eksonit
6 eksonia 81,3 kb:n alueella
Proteiini
1 195 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FLJ35036, CIBZ, ZNF921, PPP1R171
MANE Select -transkripti
ENST00000321464.7NM_001376113.1
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä ZBTB38. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

ZBTB38-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 3, jossa hakasulke osoittaa ZBTB38-geenin sijainnin. ZBTB38 ja 8 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 3, välillä 140 909 148–141 909 147.Kromosomi 33q23p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 MbSLC25A36: 140 941 797–140 980 995, juoste eteenpäinSLC25A36SPSB4: 141 050 744–141 148 613, juoste eteenpäinSPSB4PXYLP1: 141 228 726–141 367 753, juoste eteenpäinPXYLP1ZBTB38: 141 368 504–141 449 792, juoste eteenpäinZBTB38RASA2: 141 486 967–141 615 362, juoste eteenpäinRASA2RNF7: 141 738 189–141 747 611, juoste eteenpäinRNF7: 141 738 474–141 807 919, juoste eteenpäinGRK7: 141 763 408–141 819 352, juoste eteenpäinGRK7ATP1B3: 141 876 111–141 927 499, juoste eteenpäinATP1B3ZBTB38-kaavio: 6 eksonia kromosomin 3 juosteella, eteenpäinEkson 1: 141 368 504–141 368 804, 301 emästäEkson 2: 141 369 872–141 369 946, 75 emästäEkson 3: 141 381 425–141 381 487, 63 emästäEkson 4: 141 386 872–141 386 937, 66 emästäEkson 5: 141 403 927–141 404 031, 105 emästäEkson 6: 141 442 389–141 449 792, 7 404 emästä1234565′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 8 kb geenin 81,3 kb:stä; 3 588 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

ZBTB38-geenin sekvensointi

2Helppo

Kuinka vaikea ZBTB38-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki ZBTB38-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa ZBTB38-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenssin peittävyys0 %
  • Toistot2,3 %
  • GC-pitoisuus5,1 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). ZBTB38-geeni: zinc finger and BTB domain containing 38. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/zbtb38

Vancouver

Dante Labs. ZBTB38-geeni: zinc finger and BTB domain containing 38 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/zbtb38

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test