Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

TNRC6A

trinucleotide repeat containing adaptor 6A

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
16p12.1
Koordinaatit
Kromosomi 16: 24 729 651–24 826 218 (GRCh38)
Eksonit
25 eksonia 96,6 kb:n alueella
Proteiini
1 962 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
CAGH26, KIAA1460, GW182
Aiemmat symbolit
TNRC6
MANE Select -transkripti
ENST00000395799.8NM_014494.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä TNRC6A. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

TNRC6A-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 16, jossa hakasulke osoittaa TNRC6A-geenin sijainnin. TNRC6A ja 7 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 16, välillä 24 277 935–25 277 934.Kromosomi 1616p12.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.324,4 Mb24,6 Mb24,8 Mb25 Mb25,2 MbCACNG3: 24 256 194–24 362 412, juoste eteenpäinCACNG3RBBP6: 24 537 693–24 572 863, juoste eteenpäinRBBP6TNRC6A: 24 729 651–24 826 218, juoste eteenpäinTNRC6ASLC5A11: 24 845 841–24 911 628, juoste eteenpäinSLC5A11ARHGAP17: 24 917 803–25 015 666, juoste taaksepäinARHGAP17LCMT1: 25 111 704–25 178 232, juoste eteenpäinLCMT1AQP8: 25 215 731–25 228 936, juoste eteenpäinAQP8ZKSCAN2: 25 236 001–25 257 859, juoste taaksepäinZKSCAN2TNRC6A-kaavio: 25 eksonia kromosomin 16 juosteella, eteenpäinEkson 1: 24 729 651–24 729 846, 196 emästäEkson 2: 24 730 253–24 730 300, 48 emästäEkson 3: 24 750 726–24 750 813, 88 emästäEkson 4: 24 758 339–24 758 360, 22 emästäEkson 5: 24 776 933–24 777 358, 426 emästäEkson 6: 24 789 232–24 791 817, 2 586 emästäEkson 7: 24 793 473–24 793 649, 177 emästäEkson 8: 24 794 544–24 794 719, 176 emästäEkson 9: 24 795 907–24 795 939, 33 emästäEkson 10: 24 797 490–24 797 570, 81 emästäEkson 11: 24 797 915–24 797 966, 52 emästäEkson 12: 24 804 177–24 804 319, 143 emästäEkson 13: 24 804 705–24 804 851, 147 emästäEkson 14: 24 805 014–24 805 151, 138 emästäEkson 15: 24 805 605–24 805 733, 129 emästäEkson 16: 24 806 206–24 806 283, 78 emästäEkson 17: 24 806 574–24 806 784, 211 emästäEkson 18: 24 809 350–24 809 481, 132 emästäEkson 19: 24 815 147–24 815 305, 159 emästäEkson 20: 24 816 816–24 816 956, 141 emästäEkson 21: 24 818 593–24 818 700, 108 emästäEkson 22: 24 820 139–24 820 360, 222 emästäEkson 23: 24 822 077–24 822 147, 71 emästäEkson 24: 24 822 874–24 823 013, 140 emästäEkson 25: 24 823 432–24 826 218, 2 787 emästä15101520255′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 8,5 kb geenin 96,6 kb:stä; 5 889 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

TNRC6A-geenin sekvensointi

3Helppo

Kuinka vaikea TNRC6A-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki TNRC6A-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa TNRC6A-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot6,9 %
  • GC-pitoisuus3 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Geeniin TNRC6A liittyvät piirteet

Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TNRC6A voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). TNRC6A-geeni: trinucleotide repeat containing adaptor 6A. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tnrc6a

Vancouver

Dante Labs. TNRC6A-geeni: trinucleotide repeat containing adaptor 6A [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tnrc6a

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test