Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

TNPO1

transportin 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5q13.2
Koordinaatit
Kromosomi 5: 72 816 661–72 914 388 (GRCh38)
Eksonit
25 eksonia 97,7 kb:n alueella
Proteiini
898 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
MIP, TRN, IPO2, MIP1
Aiemmat symbolit
KPNB2
MANE Select -transkripti
ENST00000337273.10NM_002270.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä TNPO1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

TNPO1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa TNPO1-geenin sijainnin. TNPO1 ja 5 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 72 365 525–73 365 524.Kromosomi 55q13.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.372,4 Mb72,6 Mb72,8 Mb73 Mb73,2 MbPTCD2: 72 320 318–72 368 395, juoste eteenpäinPTCD2ZNF366: 72 439 903–72 507 428, juoste taaksepäinZNF366TNPO1: 72 816 661–72 914 388, juoste eteenpäinTNPO1FCHO2: 72 955 527–73 090 522, juoste eteenpäinFCHO2TMEM171: 73 120 547–73 131 823, juoste eteenpäinTMEM171TMEM174: 73 173 193–73 175 143, juoste eteenpäinTMEM174TNPO1-kaavio: 25 eksonia kromosomin 5 juosteella, eteenpäinEkson 1: 72 816 661–72 816 752, 92 emästäEkson 2: 72 848 385–72 848 498, 114 emästäEkson 3: 72 851 244–72 851 319, 76 emästäEkson 4: 72 855 774–72 855 923, 150 emästäEkson 5: 72 861 808–72 861 914, 107 emästäEkson 6: 72 865 596–72 865 729, 134 emästäEkson 7: 72 872 639–72 872 720, 82 emästäEkson 8: 72 875 615–72 875 737, 123 emästäEkson 9: 72 877 228–72 877 346, 119 emästäEkson 10: 72 882 467–72 882 527, 61 emästäEkson 11: 72 883 064–72 883 232, 169 emästäEkson 12: 72 887 070–72 887 222, 153 emästäEkson 13: 72 888 078–72 888 303, 226 emästäEkson 14: 72 889 786–72 889 957, 172 emästäEkson 15: 72 891 810–72 891 896, 87 emästäEkson 16: 72 893 139–72 893 246, 108 emästäEkson 17: 72 893 377–72 893 535, 159 emästäEkson 18: 72 893 616–72 893 703, 88 emästäEkson 19: 72 896 458–72 896 556, 99 emästäEkson 20: 72 897 056–72 897 151, 96 emästäEkson 21: 72 900 006–72 900 081, 76 emästäEkson 22: 72 900 974–72 901 073, 100 emästäEkson 23: 72 903 709–72 903 783, 75 emästäEkson 24: 72 905 303–72 905 445, 143 emästäEkson 25: 72 908 709–72 914 388, 5 680 emästä15101520255′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 8,5 kb geenin 97,7 kb:stä; 2 697 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

TNPO1-geenin sekvensointi

16Kohtalainen

Kuinka vaikea TNPO1-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Osa TNPO1-geenin eksoneista sijaitsee kohdissa, joissa lyhyet lukemat voivat jättää muutoksen huomaamatta tai sijoittaa sen väärin.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa TNPO1-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus2,3 %
  • Homologia19 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot4,5 %
  • GC-pitoisuus8 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). TNPO1-geeni: transportin 1. Haettu 21. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tnpo1

Vancouver

Dante Labs. TNPO1-geeni: transportin 1 [Internet]. [viitattu 21. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tnpo1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test