Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

TNPO1

transportin 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
5q13.2
Współrzędne
Chromosom 5: 72 816 661–72 914 388 (GRCh38)
Eksony
25 eksonów na odcinku 97,7 kb
Białko
898 aminokwasów
Znany również jako
MIP, TRN, IPO2, MIP1
Poprzednie symbole
KPNB2
Transkrypt MANE Select
ENST00000337273.10NM_002270.4
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu TNPO1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu TNPO1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 5, z nawiasem wskazującym położenie TNPO1. TNPO1 i 5 genów w pobliżu na chromosomie 5, od 72 365 525 do 73 365 524.Chromosom 55q13.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.372,4 Mb72,6 Mb72,8 Mb73 Mb73,2 MbPTCD2: 72 320 318–72 368 395, nić dodatniejPTCD2ZNF366: 72 439 903–72 507 428, nić ujemnejZNF366TNPO1: 72 816 661–72 914 388, nić dodatniejTNPO1FCHO2: 72 955 527–73 090 522, nić dodatniejFCHO2TMEM171: 73 120 547–73 131 823, nić dodatniejTMEM171TMEM174: 73 173 193–73 175 143, nić dodatniejTMEM174Schemat TNPO1: 25 eksonów na nici dodatniej chromosomu 5Ekson 1: 72 816 661–72 816 752, 92 zasadEkson 2: 72 848 385–72 848 498, 114 zasadEkson 3: 72 851 244–72 851 319, 76 zasadEkson 4: 72 855 774–72 855 923, 150 zasadEkson 5: 72 861 808–72 861 914, 107 zasadEkson 6: 72 865 596–72 865 729, 134 zasadEkson 7: 72 872 639–72 872 720, 82 zasadEkson 8: 72 875 615–72 875 737, 123 zasadEkson 9: 72 877 228–72 877 346, 119 zasadEkson 10: 72 882 467–72 882 527, 61 zasadEkson 11: 72 883 064–72 883 232, 169 zasadEkson 12: 72 887 070–72 887 222, 153 zasadEkson 13: 72 888 078–72 888 303, 226 zasadEkson 14: 72 889 786–72 889 957, 172 zasadEkson 15: 72 891 810–72 891 896, 87 zasadEkson 16: 72 893 139–72 893 246, 108 zasadEkson 17: 72 893 377–72 893 535, 159 zasadEkson 18: 72 893 616–72 893 703, 88 zasadEkson 19: 72 896 458–72 896 556, 99 zasadEkson 20: 72 897 056–72 897 151, 96 zasadEkson 21: 72 900 006–72 900 081, 76 zasadEkson 22: 72 900 974–72 901 073, 100 zasadEkson 23: 72 903 709–72 903 783, 75 zasadEkson 24: 72 905 303–72 905 445, 143 zasadEkson 25: 72 908 709–72 914 388, 5680 zasad15101520255′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 8,5 kb z 97,7 kb genu; 2697 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie TNPO1

16Umiarkowanie

Jak trudno zsekwencjonować TNPO1 krótkimi odczytami, w skali do 100

Część eksonów TNPO1 znajduje się w miejscach, gdzie krótkie odczyty mogą przeoczyć zmianę lub przypisać ją w niewłaściwym miejscu.

Co na to wpływa: udział eksonów TNPO1 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność2,3%
  • Homologia19%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia4,5%
  • Zawartość GC8%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen TNPO1: transportin 1. Pobrano 20 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/tnpo1

Vancouver

Dante Labs. Gen TNPO1: transportin 1 [Internet]. [cytowano 20 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/tnpo1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test