Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

TAFA5

TAFA chemokine like family member 5

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
22q13.32
Koordinaatit
Kromosomi 22: 48 489 553–48 751 932 (GRCh38)
Eksonit
4 eksonia 262,4 kb:n alueella
Proteiini
132 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
TAFA-5
Aiemmat symbolit
FAM19A5
MANE Select -transkripti
ENST00000402357.6NM_001082967.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä TAFA5. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

TAFA5-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 22, jossa hakasulke osoittaa TAFA5-geenin sijainnin. TAFA5 ja 0 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 22, välillä 48 120 743–49 120 742.Kromosomi 2222q13.32p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3348,2 Mb48,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 MbTAFA5: 48 489 553–48 751 932, juoste eteenpäinTAFA5TAFA5-kaavio: 4 eksonia kromosomin 22 juosteella, eteenpäinEkson 1: 48 489 553–48 489 704, 152 emästäEkson 2: 48 646 597–48 646 746, 150 emästäEkson 3: 48 707 717–48 707 844, 128 emästäEkson 4: 48 749 839–48 751 932, 2 094 emästä12345′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,5 kb geenin 262,4 kb:stä; 399 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

TAFA5-geenin sekvensointi

15Kohtalainen

Kuinka vaikea TAFA5-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Osa TAFA5-geenin eksoneista sijaitsee kohdissa, joissa lyhyet lukemat voivat jättää muutoksen huomaamatta tai sijoittaa sen väärin.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa TAFA5-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot3 %
  • GC-pitoisuus69 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). TAFA5-geeni: TAFA chemokine like family member 5. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tafa5

Vancouver

Dante Labs. TAFA5-geeni: TAFA chemokine like family member 5 [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tafa5

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test