Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

RUNDC3B

RUN domain containing 3B

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
7q21.12
Koordinaatit
Kromosomi 7: 87 628 398–87 832 296 (GRCh38)
Eksonit
11 eksonia 203,9 kb:n alueella
Proteiini
456 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
RPIP9, RPIB9
MANE Select -transkripti
ENST00000394654.4NM_001134405.2
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä RUNDC3B. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

RUNDC3B-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 7, jossa hakasulke osoittaa RUNDC3B-geenin sijainnin. RUNDC3B ja 7 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 7, välillä 87 230 347–88 230 346.Kromosomi 77q21.12p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.387,4 Mb87,6 Mb87,8 Mb88 Mb88,2 MbCROT: 87 317 127–87 399 800, juoste eteenpäinCROTABCB4: 87 400 393–87 480 435, juoste taaksepäinABCB4ABCB1: 87 501 989–87 713 379, juoste taaksepäinABCB1RUNDC3B: 87 628 398–87 832 296, juoste eteenpäinRUNDC3BSLC25A40: 87 833 561–87 876 404, juoste taaksepäinSLC25A40DBF4: 87 876 216–87 909 553, juoste eteenpäinDBF4ADAM22: 87 934 136–88 202 889, juoste eteenpäinADAM22SRI: 88 201 117–88 226 997, juoste taaksepäinSRIRUNDC3B-kaavio: 11 eksonia kromosomin 7 juosteella, eteenpäinEkson 1: 87 628 398–87 628 945, 548 emästäEkson 2: 87 650 822–87 650 937, 116 emästäEkson 3: 87 700 421–87 700 554, 134 emästäEkson 4: 87 710 570–87 710 655, 86 emästäEkson 5: 87 739 791–87 739 880, 90 emästäEkson 6: 87 741 499–87 741 579, 81 emästäEkson 7: 87 770 581–87 770 749, 169 emästäEkson 8: 87 777 798–87 777 955, 158 emästäEkson 9: 87 807 373–87 807 519, 147 emästäEkson 10: 87 816 141–87 816 262, 122 emästäEkson 11: 87 829 885–87 832 296, 2 412 emästä1246810115′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,1 kb geenin 203,9 kb:stä; 1 371 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: RUNDC3B

2Helppo

Kuinka vaikea RUNDC3B on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin RUNDC3B eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin RUNDC3B eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot5,4 %
  • GC-pitoisuus14 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). RUNDC3B-geeni: RUN domain containing 3B. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rundc3b

Vancouver

Dante Labs. RUNDC3B-geeni: RUN domain containing 3B [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rundc3b

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test