Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

RPH3AL

rabphilin 3A like (without C2 domains)

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
17p13.3
Koordinaatit
Kromosomi 17: 212 389–352 807 (GRCh38)
Eksonit
10 eksonia 140,4 kb:n alueella
Proteiini
315 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
Noc2
MANE Select -transkripti
ENST00000331302.12NM_006987.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä RPH3AL. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

RPH3AL-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 17, jossa hakasulke osoittaa RPH3AL-geenin sijainnin. RPH3AL ja 9 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 17, välillä 1–782 597.Kromosomi 1717p13.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.30,1 Mb0,2 Mb0,3 Mb0,4 Mb0,5 Mb0,6 Mb0,7 MbSCGB1C2: 137 569–139 067, juoste eteenpäinSCGB1C2DOC2B: 142 789–181 691, juoste taaksepäinDOC2BRPH3AL: 212 389–352 807, juoste taaksepäinRPH3ALLIAT1: 410 302–431 062, juoste eteenpäinLIAT1RFLNB: 439 978–445 939, juoste taaksepäinRFLNBVPS53: 508 503–721 717, juoste taaksepäinVPS53TLCD3A: 732 412–743 009, juoste eteenpäinTLCD3AGEMIN4: 742 840–753 999, juoste taaksepäinGEMIN4GLOD4: 757 097–782 341, juoste taaksepäinGLOD4MRM3: 782 342–792 510, juoste eteenpäinMRM3RPH3AL-kaavio: 10 eksonia kromosomin 17 juosteella, taaksepäinEkson 10: 212 389–213 923, 1 535 emästäEkson 9: 215 654–215 802, 149 emästäEkson 8: 219 623–219 736, 114 emästäEkson 7: 247 111–247 285, 175 emästäEkson 6: 281 768–281 854, 87 emästäEkson 5: 319 420–319 549, 130 emästäEkson 4: 321 272–321 415, 144 emästäEkson 3: 327 467–327 579, 113 emästäEkson 2: 333 759–333 934, 176 emästäEkson 1: 352 712–352 807, 96 emästä10864215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,7 kb geenin 140,4 kb:stä; 948 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: RPH3AL

2Helppo

Kuinka vaikea RPH3AL on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin RPH3AL eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin RPH3AL eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot0,9 %
  • GC-pitoisuus18 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). RPH3AL-geeni: rabphilin 3A like (without C2 domains). Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rph3al

Vancouver

Dante Labs. RPH3AL-geeni: rabphilin 3A like (without C2 domains) [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rph3al

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test