Geeni
RNU11
RNA, U11 small nuclear
- HGNC 10108↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000274978↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 26824↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1p35.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 28 648 600–28 648 734 (GRCh38)
- Eksonit
- 1 eksoni 0,1 kb:n alueella
- Tunnetaan myös nimellä
- U11, RNU11-1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000387069.2NR_004407.1
- Lokustyyppi
- Pieni ydin-RNA (snRNA)
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue RNU11 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä RNU11. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.
RNU11-geenin rakenne
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 0,1 kb geenin 0,1 kb:stä.
Sekvensointi: RNU11
0Helppo
Kuinka vaikea RNU11 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100
0 · Helppo100 · Vaikea
Lähes kaikki geenin RNU11 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.
Lisäksi vaikuttaa: geenin RNU11 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa
- KartoitettavuusKohdat, joissa 100 tai 250 emäsparin lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten muutos siellä voi jäädä huomaamatta tai olla virheellinen. Paino 35 %.0 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatiot: kopiot muualla genomissa, kuten paraloogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identiteetillä. Paino 30 %.0 %
- ToistotTandem-toistot ja saman emäksen jaksot, joilla lukemat luistavat eivätkä välttämättä kata niitä. Paino 15 %.0 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emäksiä on alle 25 % tai yli 65 %, joita kirjastovalmistelu kattaa ohuesti. Paino 10 %.0 %
- ReferenssikattavuusReferenssikokoonpanon aukot lähellä, joissa ei ole sekvenssiä, johon lukemat voisivat kohdistua. Paino 10 %.0 %
Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaanJokainen palkki kuvaa sitä osuutta geenin RNU11 eksonien emäksistä, joka on kyseisessä vaikeassa alueluokassa. Pistemäärässä kukin luokka painotetaan sen mukaan, kuinka paljon se vaikeuttaa muutosten luotettavaa havaitsemista lyhyillä lukemilla: 0, kun mikään emäs ei ole missään luokassa, 100, kun jokainen emäs on kaikissa niistä.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Kliininen
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RNU11-geeni: RNA, U11 small nuclear. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rnu11
Dante Labs. RNU11-geeni: RNA, U11 small nuclear [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rnu11
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa