Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

RAD21L1

RAD21 cohesin complex component like 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
20p13
Koordinaatit
Kromosomi 20: 1 226 044–1 255 876 (GRCh38)
Eksonit
14 eksonia 29,8 kb:n alueella
Proteiini
555 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
dJ545L17.2, RAD21L
MANE Select -transkripti
ENST00000683101.1NM_001384355.1
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä RAD21L1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

RAD21L1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 20, jossa hakasulke osoittaa RAD21L1-geenin sijainnin. RAD21L1 ja 17 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 20, välillä 740 960–1 740 959.Kromosomi 2020p13p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.330,8 Mb1 Mb1,2 Mb1,4 Mb1,6 MbSLC52A3: 758 695–776 015, juoste taaksepäinSLC52A3FAM110A: 833 707–857 463, juoste eteenpäinFAM110AANGPT4: 869 900–916 335, juoste taaksepäinANGPT4RSPO4: 958 452–1 002 510, juoste taaksepäinRSPO4PSMF1: 1 113 240–1 192 353, juoste eteenpäinPSMF1TMEM74B: 1 178 989–1 186 842, juoste taaksepäinTMEM74BC20orf202: 1 203 454–1 209 076, juoste eteenpäinC20orf202RAD21L1: 1 226 044–1 255 876, juoste eteenpäinRAD21L1SNPH: 1 266 265–1 309 328, juoste eteenpäinSNPHSDCBP2: 1 309 909–1 329 211, juoste taaksepäinSDCBP2: 1 317 571–1 393 096, juoste taaksepäinFKBP1A: 1 355 817–1 393 164, juoste taaksepäinFKBP1ANSFL1C: 1 442 162–1 473 842, juoste taaksepäinNSFL1CSIRPB2: 1 470 741–1 491 587, juoste taaksepäinSIRPB2SIRPD: 1 534 251–1 557 705, juoste taaksepäinSIRPD: 1 540 144–1 620 009, juoste taaksepäinSIRPB1: 1 561 385–1 620 061, juoste taaksepäinSIRPB1SIRPG: 1 629 152–1 657 779, juoste taaksepäinSIRPGRAD21L1-kaavio: 14 eksonia kromosomin 20 juosteella, eteenpäinEkson 1: 1 226 044–1 226 140, 97 emästäEkson 2: 1 228 422–1 228 597, 176 emästäEkson 3: 1 229 880–1 230 009, 130 emästäEkson 4: 1 231 526–1 231 619, 94 emästäEkson 5: 1 234 085–1 234 191, 107 emästäEkson 6: 1 238 044–1 238 214, 171 emästäEkson 7: 1 239 312–1 239 407, 96 emästäEkson 8: 1 240 321–1 240 434, 114 emästäEkson 9: 1 242 619–1 242 845, 227 emästäEkson 10: 1 243 097–1 243 196, 100 emästäEkson 11: 1 244 046–1 244 170, 125 emästäEkson 12: 1 246 213–1 246 305, 93 emästäEkson 13: 1 248 626–1 248 703, 78 emästäEkson 14: 1 254 269–1 255 876, 1 608 emästä124681012145′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,2 kb geenin 29,8 kb:stä; 1 668 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

RAD21L1-geenin sekvensointi

2Helppo

Kuinka vaikea RAD21L1-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki RAD21L1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa RAD21L1-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot2,3 %
  • GC-pitoisuus5,7 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). RAD21L1-geeni: RAD21 cohesin complex component like 1. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rad21l1

Vancouver

Dante Labs. RAD21L1-geeni: RAD21 cohesin complex component like 1 [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rad21l1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test