Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

PRDM9

PR/SET domain 9

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5p14.2
Koordinaatit
Kromosomi 5: 23 507 609–23 528 093 (GRCh38)
Eksonit
11 eksonia 20,5 kb:n alueella
Proteiini
894 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
PFM6, ZNF899, KMT8B, Meisetz
Aiemmat symbolit
MSBP3
MANE Select -transkripti
ENST00000296682.4NM_020227.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä PRDM9. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

PRDM9-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa PRDM9-geenin sijainnin. PRDM9 ja 0 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 23 017 851–24 017 850.Kromosomi 55p14.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.323,2 Mb23,4 Mb23,6 Mb23,8 Mb24 MbPRDM9: 23 507 609–23 528 093, juoste eteenpäinPRDM9PRDM9-kaavio: 11 eksonia kromosomin 5 juosteella, eteenpäinEkson 1: 23 507 609–23 507 712, 104 emästäEkson 2: 23 508 950–23 509 102, 153 emästäEkson 3: 23 509 470–23 509 593, 124 emästäEkson 4: 23 509 920–23 510 027, 108 emästäEkson 5: 23 517 881–23 517 930, 50 emästäEkson 6: 23 521 023–23 521 179, 157 emästäEkson 7: 23 522 304–23 522 405, 102 emästäEkson 8: 23 522 614–23 522 885, 272 emästäEkson 9: 23 523 291–23 523 358, 68 emästäEkson 10: 23 524 334–23 524 527, 194 emästäEkson 11: 23 526 233–23 528 093, 1 861 emästä12345678910115′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,2 kb geenin 20,5 kb:stä; 2 685 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: PRDM9

45Korkea

Kuinka vaikea PRDM9 on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

  • Kartoitettavuus28 %
  • Homologia100 %
  • Toistot34 %
  • GC-pitoisuus0 %
  • Referenssin peittävyys0 %

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). PRDM9-geeni: PR/SET domain 9. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/prdm9

Vancouver

Dante Labs. PRDM9-geeni: PR/SET domain 9 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/prdm9

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test