Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

PRDM9

PR/SET domain 9

Sammanfattning

Cytogenetisk position
5p14.2
Koordinater
Kromosom 5: 23 507 609–23 528 093 (GRCh38)
Exoner
11 exoner på 20,5 kb
Protein
894 aminosyror
Även känd som
PFM6, ZNF899, KMT8B, Meisetz
Tidigare symboler
MSBP3
MANE Select-transkript
ENST00000296682.4NM_020227.4
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser PRDM9 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är PRDM9 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 5, med en parentes där PRDM9 finns. PRDM9 och 0 gener i närheten på kromosom 5, från 23 017 851 till 24 017 850.Kromosom 55p14.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.323,2 Mb23,4 Mb23,6 Mb23,8 Mb24 MbPRDM9: 23 507 609–23 528 093, framåt-strängPRDM9Diagram över PRDM9: 11 exoner på framåt-strängen av kromosom 5Exon 1: 23 507 609–23 507 712, 104 baserExon 2: 23 508 950–23 509 102, 153 baserExon 3: 23 509 470–23 509 593, 124 baserExon 4: 23 509 920–23 510 027, 108 baserExon 5: 23 517 881–23 517 930, 50 baserExon 6: 23 521 023–23 521 179, 157 baserExon 7: 23 522 304–23 522 405, 102 baserExon 8: 23 522 614–23 522 885, 272 baserExon 9: 23 523 291–23 523 358, 68 baserExon 10: 23 524 334–23 524 527, 194 baserExon 11: 23 526 233–23 528 093, 1 861 baser12345678910115′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 3,2 kb av genens 20,5 kb, och 2 685 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av PRDM9

45Svår

Hur svår PRDM9 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Stora delar av PRDM9 ligger där korta läsningar kan missa eller felplacera en förändring.

Det som adderar: andelen av PRDM9:s exoner i varje typ av svårt område

  • Mappbarhet28 %
  • Homologi100 %
  • Repetitioner34 %
  • GC-innehåll0 %
  • Referenstäckning0 %

En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängen

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). PRDM9-genen: PR/SET domain 9. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/prdm9

Vancouver

Dante Labs. PRDM9-genen: PR/SET domain 9 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/prdm9

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test