Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

NKAIN2

sodium/potassium transporting ATPase interacting 2

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
6q22.31
Koordinaatit
Kromosomi 6: 123 803 865–124 825 640 (GRCh38)
Eksonit
7 eksonia 1 021,8 kb:n alueella
Proteiini
208 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FAM77B
Aiemmat symbolit
TCBA1
MANE Select -transkripti
ENST00000368417.6NM_001040214.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä NKAIN2. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

NKAIN2-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 6, jossa hakasulke osoittaa NKAIN2-geenin sijainnin. NKAIN2 ja 9 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 6, välillä 122 782 089–125 847 416.Kromosomi 66q22.31p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27123 Mb123,5 Mb124 Mb124,5 Mb125 Mb125,5 MbFABP7: 122 779 597–122 784 074, juoste eteenpäinFABP7SMPDL3A: 122 788 456–122 811 801, juoste eteenpäinSMPDL3ACLVS2: 122 996 029–123 072 925, juoste eteenpäinCLVS2TRDN: 123 215 088–123 637 316, juoste taaksepäinTRDNNKAIN2: 123 803 865–124 825 640, juoste eteenpäinNKAIN2RNF217: 124 961 875–125 092 633, juoste eteenpäinRNF217TPD52L1: 125 119 049–125 264 407, juoste eteenpäinTPD52L1HDDC2: 125 219 962–125 302 146, juoste taaksepäinHDDC2HEY2: 125 747 664–125 763 049, juoste eteenpäinHEY2NCOA7: 125 780 943–125 932 034, juoste eteenpäinNCOA7NKAIN2-kaavio: 7 eksonia kromosomin 6 juosteella, eteenpäinEkson 1: 123 803 865–123 804 254, 390 emästäEkson 2: 124 283 005–124 283 142, 138 emästäEkson 3: 124 355 267–124 355 347, 81 emästäEkson 4: 124 658 186–124 658 386, 201 emästäEkson 5: 124 791 339–124 791 399, 61 emästäEkson 6: 124 818 387–124 818 468, 82 emästäEkson 7: 124 823 220–124 825 640, 2 421 emästä1575′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,4 kb geenin 1 021,8 kb:stä; 627 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: NKAIN2

2Helppo

Kuinka vaikea NKAIN2 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin NKAIN2 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin NKAIN2 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot5,7 %
  • GC-pitoisuus14 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). NKAIN2-geeni: sodium/potassium transporting ATPase interacting 2. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/nkain2

Vancouver

Dante Labs. NKAIN2-geeni: sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/nkain2

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test