Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

IFNA5

interferon alpha 5

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
9p21.3
Koordinaatit
Kromosomi 9: 21 304 326–21 305 313 (GRCh38)
Eksonit
1 eksoni 1 kb:n alueella
Proteiini
189 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
IFN-alphaG
MANE Select -transkripti
ENST00000610521.2NM_002169.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä IFNA5. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

IFNA5-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 9, jossa hakasulke osoittaa IFNA5-geenin sijainnin. IFNA5 ja 19 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 9, välillä 20 804 820–21 804 819.Kromosomi 99p21.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.321 Mb21,2 Mb21,4 Mb21,6 Mb21,8 MbFOCAD: 20 658 305–20 999 329, juoste eteenpäinFOCADHACD4: 20 993 514–21 031 652, juoste taaksepäinHACD4IFNB1: 21 077 104–21 077 942, juoste taaksepäinIFNB1IFNW1: 21 140 632–21 141 832, juoste taaksepäinIFNW1IFNA21: 21 165 637–21 166 660, juoste taaksepäinIFNA21IFNA4: 21 186 618–21 187 587, juoste taaksepäinIFNA7: 21 201 469–21 202 205, juoste taaksepäinIFNA10: 21 206 181–21 207 143, juoste taaksepäinIFNA10IFNA16: 21 216 373–21 217 311, juoste taaksepäinIFNA16IFNA17: 21 227 243–21 228 222, juoste taaksepäinIFNA17IFNA14: 21 239 002–21 240 005, juoste taaksepäinIFNA14IFNA5: 21 304 326–21 305 313, juoste taaksepäinIFNA5KLHL9: 21 320 024–21 335 404, juoste taaksepäinKLHL9IFNA6: 21 350 253–21 350 956, juoste taaksepäinIFNA6IFNA13: 21 367 372–21 368 057, juoste taaksepäinIFNA13IFNA2: 21 384 255–21 385 398, juoste taaksepäinIFNA2IFNA8: 21 409 117–21 410 185, juoste eteenpäinIFNA8IFNA1: 21 440 439–21 441 316, juoste eteenpäinIFNA1IFNE: 21 480 839–21 482 313, juoste taaksepäinIFNEMTAP: 21 802 614–21 937 651, juoste eteenpäinMTAPIFNA5-kaavio: yksi ekson kromosomin 9 juosteella, taaksepäinEkson 1: 21 304 326–21 305 313, 988 emästä15′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1 kb geenin 1 kb:stä; 570 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: IFNA5

6Helppo

Kuinka vaikea IFNA5 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin IFNA5 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin IFNA5 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus8,8 %
  • Homologia0 %
  • Toistot9,8 %
  • GC-pitoisuus18 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). IFNA5-geeni: interferon alpha 5. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ifna5

Vancouver

Dante Labs. IFNA5-geeni: interferon alpha 5 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ifna5

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test