Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

CHL1

cell adhesion molecule L1 like

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
3p26.3
Koordinaatit
Kromosomi 3: 196 763–409 417 (GRCh38)
Eksonit
28 eksonia 212,7 kb:n alueella
Proteiini
1 224 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
CALL, L1CAM2, FLJ44930, MGC132578
MANE Select -transkripti
ENST00000256509.7NM_006614.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä CHL1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

CHL1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 3, jossa hakasulke osoittaa CHL1-geenin sijainnin. CHL1 ja 0 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 3, välillä 1–803 089.Kromosomi 33p26.3p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q290,1 Mb0,2 Mb0,3 Mb0,4 Mb0,5 Mb0,6 Mb0,7 Mb0,8 MbCHL1: 196 763–409 417, juoste eteenpäinCHL1CHL1-kaavio: 28 eksonia kromosomin 3 juosteella, eteenpäinEkson 1: 196 763–197 063, 301 emästäEkson 2: 244 613–244 692, 80 emästäEkson 3: 319 683–319 867, 185 emästäEkson 4: 325 959–326 064, 106 emästäEkson 5: 328 167–328 354, 188 emästäEkson 6: 340 794–340 916, 123 emästäEkson 7: 341 912–342 082, 171 emästäEkson 8: 342 984–343 031, 48 emästäEkson 9: 344 589–344 709, 121 emästäEkson 10: 349 359–349 543, 185 emästäEkson 11: 354 640–354 771, 132 emästäEkson 12: 360 284–360 424, 141 emästäEkson 13: 361 699–361 810, 112 emästäEkson 14: 363 217–363 383, 167 emästäEkson 15: 365 950–366 115, 166 emästäEkson 16: 377 818–377 942, 125 emästäEkson 17: 382 179–382 280, 102 emästäEkson 18: 382 474–382 671, 198 emästäEkson 19: 383 816–383 886, 71 emästäEkson 20: 389 252–389 474, 223 emästäEkson 21: 390 701–390 816, 116 emästäEkson 22: 390 955–391 159, 205 emästäEkson 23: 391 675–391 797, 123 emästäEkson 24: 394 693–394 872, 180 emästäEkson 25: 398 227–398 385, 159 emästäEkson 26: 399 017–399 148, 132 emästäEkson 27: 401 626–401 698, 73 emästäEkson 28: 405 495–409 417, 3 923 emästä1510152025285′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 7,9 kb geenin 212,7 kb:stä; 3 675 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: CHL1

1Helppo

Kuinka vaikea CHL1 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin CHL1 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin CHL1 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot2,1 %
  • GC-pitoisuus7 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). CHL1-geeni: cell adhesion molecule L1 like. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/chl1

Vancouver

Dante Labs. CHL1-geeni: cell adhesion molecule L1 like [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/chl1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test