Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

CENPO

centromere protein O

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
2p23.3
Koordinaatit
Kromosomi 2: 24 793 425–24 822 376 (GRCh38)
Eksonit
8 eksonia 29 kb:n alueella
Proteiini
300 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
MGC11266, CENP-O
MANE Select -transkripti
ENST00000380834.7NM_001322101.2
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä CENPO. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

CENPO-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 2, jossa hakasulke osoittaa CENPO-geenin sijainnin. CENPO ja 8 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 2, välillä 24 307 901–25 307 900.Kromosomi 22p23.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.324,4 Mb24,6 Mb24,8 Mb25 Mb25,2 MbITSN2: 24 202 864–24 360 807, juoste taaksepäinITSN2NCOA1: 24 490 983–24 770 702, juoste eteenpäinNCOA1PTRHD1: 24 788 911–24 793 395, juoste taaksepäinPTRHD1CENPO: 24 793 425–24 822 376, juoste eteenpäinCENPOADCY3: 24 819 169–24 920 299, juoste taaksepäinADCY3DNAJC27: 24 943 636–24 972 094, juoste taaksepäinDNAJC27EFR3B: 25 042 048–25 159 135, juoste eteenpäinEFR3BPOMC: 25 160 361–25 168 952, juoste taaksepäinPOMCDNMT3A: 25 227 855–25 342 590, juoste taaksepäinDNMT3ACENPO-kaavio: 8 eksonia kromosomin 2 juosteella, eteenpäinEkson 1: 24 793 425–24 793 501, 77 emästäEkson 2: 24 793 852–24 793 965, 114 emästäEkson 3: 24 799 675–24 799 844, 170 emästäEkson 4: 24 814 376–24 814 493, 118 emästäEkson 5: 24 815 497–24 815 756, 260 emästäEkson 6: 24 816 646–24 816 817, 172 emästäEkson 7: 24 817 670–24 817 841, 172 emästäEkson 8: 24 819 354–24 822 376, 3 023 emästä123456785′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,1 kb geenin 29 kb:stä; 903 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

CENPO-geenin sekvensointi

3Helppo

Kuinka vaikea CENPO-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki CENPO-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa CENPO-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot1 %
  • GC-pitoisuus13 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). CENPO-geeni: centromere protein O. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cenpo

Vancouver

Dante Labs. CENPO-geeni: centromere protein O [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cenpo

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test