Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

C3orf80

chromosome 3 open reading frame 80

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
3q25.33
Koordinaatit
Kromosomi 3: 160 225 422–160 228 213 (GRCh38)
Eksonit
1 eksoni 2,8 kb:n alueella
Proteiini
247 aminohappoa
MANE Select -transkripti
ENST00000326474.5NM_001168214.2
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä C3orf80. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

C3orf80-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 3, jossa hakasulke osoittaa C3orf80-geenin sijainnin. C3orf80 ja 9 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 3, välillä 159 726 818–160 726 817.Kromosomi 33q25.33p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29159,8 Mb160 Mb160,2 Mb160,4 Mb160,6 MbIQCJ-SCHIP1: 158 962 235–159 897 358, juoste eteenpäinIQCJ-SCHIP1SCHIP1: 159 273 244–159 897 629, juoste eteenpäinSCHIP1IL12A: 159 988 830–159 996 019, juoste eteenpäinIL12AC3orf80: 160 225 422–160 228 213, juoste eteenpäinC3orf80TRIM59-IFT80: 160 227 454–160 449 829, juoste taaksepäinTRIM59-IFT80IFT80: 160 256 986–160 400 357, juoste taaksepäinIFT80SMC4: 160 399 274–160 437 759, juoste eteenpäinSMC4TRIM59: 160 432 445–160 485 773, juoste taaksepäinTRIM59KPNA4: 160 495 007–160 565 591, juoste taaksepäinKPNA4ARL14: 160 677 160–160 678 448, juoste eteenpäinARL14C3orf80-kaavio: yksi ekson kromosomin 3 juosteella, eteenpäinEkson 1: 160 225 422–160 228 213, 2 792 emästä15′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,8 kb geenin 2,8 kb:stä; 744 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

C3orf80-geenin sekvensointi

17Kohtalainen

Kuinka vaikea C3orf80-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Osa C3orf80-geenin eksoneista sijaitsee kohdissa, joissa lyhyet lukemat voivat jättää muutoksen huomaamatta tai sijoittaa sen väärin.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa C3orf80-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot6,5 %
  • GC-pitoisuus79 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). C3orf80-geeni: chromosome 3 open reading frame 80. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/c3orf80

Vancouver

Dante Labs. C3orf80-geeni: chromosome 3 open reading frame 80 [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/c3orf80

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test