Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

PRAMEF13

PRAME family member 13

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1p36.21
Koordinaadid
Kromosoom 1: 13 196 188–13 201 409 (GRCh38)
Eksonid
4 eksonit, ulatus 5,2 kb
Valk
474 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000625019.3NM_001291380.1
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PRAMEF13 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PRAMEF13 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub PRAMEF13. PRAMEF13 ja sellele lähedal asuvad 29 geeni kromosoomil 1, vahemikus 12 698 799 kuni 13 698 798.Kromosoom 11p36.21p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4412,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb13,6 MbAADACL3: 12 716 109–12 728 760, otsene ahelAADACL3CFAP107: 12 746 194–12 763 699, otsene ahelCFAP107PRAMEF12: 12 773 738–12 777 906, otsene ahelPRAMEF12PRAMEF1: 12 791 397–12 796 628, otsene ahelPRAMEF1PRAMEF11: 12 824 605–12 831 410, pöördne ahelHNRNPCL1: 12 847 377–12 848 720, pöördne ahelPRAMEF2: 12 857 086–12 861 909, otsene ahelPRAMEF2PRAMEF4: 12 879 212–12 886 201, pöördne ahelPRAMEF4PRAMEF10: 12 892 250–12 898 270, pöördne ahelPRAMEF10PRAMEF7: 12 916 610–12 920 751, otsene ahelPRAMEF7PRAMEF6: 12 938 472–12 947 580, pöördne ahelPRAMEF6PRAMEF27: 13 049 476–13 056 575, pöördne ahelPRAMEF27HNRNPCL3: 13 060 769–13 062 878, otsene ahelHNRNPCL3PRAMEF25: 13 068 677–13 077 884, otsene ahelPRAMEF25HNRNPCL2: 13 115 488–13 116 854, pöördne ahelHNRNPCL2PRAMEF26: 13 148 905–13 158 116, pöördne ahelHNRNPCL4: 13 163 914–13 165 631, pöördne ahelHNRNPCL4PRAMEF9: 13 171 848–13 179 459, otsene ahelPRAMEF9PRAMEF13: 13 196 188–13 201 409, pöördne ahelPRAMEF13PRAMEF18: 13 222 695–13 226 154, pöördne ahelPRAMEF18PRAMEF5: 13 254 198–13 263 435, otsene ahelPRAMEF5PRAMEF8: 13 281 304–13 285 137, pöördne ahelPRAMEF8PRAMEF33: 13 303 539–13 308 907, otsene ahelPRAMEF33PRAMEF15: 13 315 581–13 322 598, otsene ahelPRAMEF15PRAMEF14: 13 341 892–13 347 134, pöördne ahelPRAMEF14PRAMEF19: 13 368 431–13 371 947, pöördne ahelPRAMEF19PRAMEF17: 13 389 632–13 392 629, otsene ahelPRAMEF17PRAMEF20: 13 410 450–13 421 328, otsene ahelPRAMEF20LRRC38: 13 474 973–13 514 526, pöördne ahelLRRC38PDPN: 13 583 465–13 617 960, otsene ahelPDPNPRAMEF13 skeem: 4 eksonit kromosoomi 1 pöördne ahelalEkson 4: 13 196 188–13 197 381, 1194 alustEkson 3: 13 198 328–13 198 906, 579 alustEkson 2: 13 199 303–13 199 614, 312 alustEkson 1: 13 201 332–13 201 409, 78 alust43215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,2 kb kogupikkusega 5,2 kb; neist 1425 alust kodeerivad valku.

PRAMEF13 sekveneerimine

65Raske

Kui raske on geeni PRAMEF13 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Suur osa geenist PRAMEF13 asub kohtades, kus lühikesed lugemid võivad muutuse vahele jätta või valesti paigutada.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni PRAMEF13 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus100%
  • Homoloogia100%
  • Kordused0%
  • GC-sisaldus0%
  • Referentsi katvus0%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PRAMEF13 geen: PRAME family member 13. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pramef13

Vancouver

Dante Labs. PRAMEF13 geen: PRAME family member 13 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pramef13

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test