Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

PPP1R3C

protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
10q23.32
Koordinaadid
Kromosoom 10: 91 628 442–91 633 071 (GRCh38)
Eksonid
2 eksonit, ulatus 4,6 kb
Valk
317 aminohapet
Tuntud ka kui
PTG
Varasemad tähised
PPP1R5
MANE Select transkript
ENST00000238994.6NM_005398.7
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PPP1R3C veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PPP1R3C on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
Kromosoom 10, millel on sulg kohal, kus asub PPP1R3C. PPP1R3C ja sellele lähedal asuvad 6 geeni kromosoomil 10, vahemikus 91 130 757 kuni 92 130 756.Kromosoom 1010q23.32p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.391,2 Mb91,4 Mb91,6 Mb91,8 Mb92 MbPCGF5: 91 162 339–91 284 337, otsene ahelPCGF5HECTD2: 91 409 280–91 514 829, otsene ahelHECTD2PPP1R3C: 91 628 442–91 633 071, pöördne ahelPPP1R3CTNKS2: 91 798 357–91 866 753, otsene ahelTNKS2FGFBP3: 91 906 496–91 909 506, pöördne ahelFGFBP3BTAF1: 91 923 758–92 031 437, otsene ahelBTAF1CPEB3: 92 046 692–92 291 628, pöördne ahelCPEB3PPP1R3C skeem: 2 eksonit kromosoomi 10 pöördne ahelalEkson 2: 91 628 442–91 630 866, 2425 alustEkson 1: 91 632 956–91 633 071, 116 alust215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,5 kb kogupikkusega 4,6 kb; neist 954 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: PPP1R3C

1Lihtne

Kui raske on geeni PPP1R3C lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni PPP1R3C eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni PPP1R3C eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Ühine chrY-ga0%
  • Viitekatvus0%
  • Kordused1,2%
  • GC-sisaldus3,5%

Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PPP1R3C geen: protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C. Vaadatud 20. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ppp1r3c

Vancouver

Dante Labs. PPP1R3C geen: protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C [Internet]. [viidatud 20. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ppp1r3c

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test