Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

LHFPL1

LHFPL tetraspan subfamily member 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
Xq23
Koordinaadid
Kromosoom X: 112 630 648–112 679 938 (GRCh38)
Eksonid
4 eksonit, ulatus 49,3 kb
Valk
220 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000371968.8NM_178175.4
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni LHFPL1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas LHFPL1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom X, millel on sulg kohal, kus asub LHFPL1. LHFPL1 ja sellele lähedal asuvad 2 geeni kromosoomil X, vahemikus 112 155 293 kuni 113 155 292.Kromosoom XXq23p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28112,2 Mb112,4 Mb112,6 Mb112,8 Mb113 MbRTL4: 112 082 965–112 458 566, otsene ahelRTL4LHFPL1: 112 630 648–112 679 938, pöördne ahelLHFPL1AMOT: 112 774 466–112 840 903, pöördne ahelAMOTLHFPL1 skeem: 4 eksonit kromosoomi X pöördne ahelalEkson 4: 112 630 648–112 631 601, 954 alustEkson 3: 112 660 627–112 660 725, 99 alustEkson 2: 112 671 009–112 671 404, 396 alustEkson 1: 112 679 829–112 679 938, 110 alust43215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,6 kb kogupikkusega 49,3 kb; neist 663 alust kodeerivad valku.

LHFPL1 sekveneerimine

2Lihtne

Kui raske on geeni LHFPL1 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni LHFPL1 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni LHFPL1 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referentsi katvus0%
  • Kordused6,1%
  • GC-sisaldus0%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). LHFPL1 geen: LHFPL tetraspan subfamily member 1. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/lhfpl1

Vancouver

Dante Labs. LHFPL1 geen: LHFPL tetraspan subfamily member 1 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/lhfpl1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test