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Gen

SPDEF

SAM pointed domain containing ETS transcription factor

Resumen

Localización citogenética
6p21.31
Coordenadas
Cromosoma 6: 34.537.802–34.556.329 (GRCh38)
Exones
6 exones en 18,5 kb
Proteína
335 aminoácidos
También conocido como
PDEF, bA375E1.3
Transcrito MANE Select
ENST00000374037.8NM_012391.3
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Genoma de referenciaGRCh38

Las posiciones en las páginas de genes y variantes siguen esta elección, en este navegador.

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún SPDEF. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de SPDEF

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 6, con un corchete donde se ubica SPDEF. SPDEF y 12 genes cercanos en el cromosoma 6, desde 34.047.066 hasta 35.047.065.Cromosoma 66p21.31p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2734,2 Mb34,4 Mb34,6 Mb34,8 Mb35 MbGRM4: 34.018.643–34.155.622, hebra inversaGRM4HMGA1: 34.235.618–34.246.236, hebra directaHMGA1SMIM29: 34.245.865–34.249.113, hebra inversaSMIM29NUDT3: 34.263.257–34.392.832, hebra inversaNUDT3RPS10-NUDT3: 34.284.887–34.426.071, hebra inversaRPS10-NUDT3RPS10: 34.417.447–34.426.237, hebra inversaRPS10PACSIN1: 34.466.040–34.536.261, hebra directaPACSIN1SPDEF: 34.537.802–34.556.329, hebra inversaSPDEFILRUN: 34.587.281–34.696.884, hebra inversaILRUNSNRPC: 34.757.097–34.774.045, hebra directaSNRPCBLTP3A: 34.792.024–34.885.350, hebra directaBLTP3ATAF11: 34.829.083–34.889.192, hebra inversaTAF11ANKS1A: 34.889.243–35.091.421, hebra directaANKS1ADiagrama de SPDEF: 6 exones en la hebra inversa del cromosoma 6Exón 6: 34.537.802–34.538.452, 651 basesExón 5: 34.539.250–34.539.396, 147 basesExón 4: 34.539.515–34.539.562, 48 basesExón 3: 34.540.984–34.541.181, 198 basesExón 2: 34.544.020–34.544.484, 465 basesExón 1: 34.555.929–34.556.329, 401 bases64215′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 1,9 kb de los 18,5 kb del gen; 1008 de esas bases codifican la proteína.

Origen de estos datos

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.

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Dante Labs. (s. f.). Gen SPDEF: SAM pointed domain containing ETS transcription factor. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/spdef

Vancouver

Dante Labs. Gen SPDEF: SAM pointed domain containing ETS transcription factor [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/spdef

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