Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA

Gen

SPDEF

SAM pointed domain containing ETS transcription factor

Shrnutí

Cytogenetická poloha
6p21.31
Souřadnice
Chromozom 6: 34 537 802–34 556 329 (GRCh38)
Exony
6 exonů na 18,5 kb
Protein
335 aminokyselin
Další názvy
PDEF, bA375E1.3
Transkript MANE Select
ENST00000374037.8NM_012391.3
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Referenční genomGRCh38

Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen SPDEF. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je SPDEF uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 6, se závorkou u SPDEF. SPDEF a 12 genů poblíž na chromozomu 6, od 34 047 066 do 35 047 065.Chromozom 66p21.31p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2734,2 Mb34,4 Mb34,6 Mb34,8 Mb35 MbGRM4: 34 018 643–34 155 622, řetězec zpětnémGRM4HMGA1: 34 235 618–34 246 236, řetězec dopřednémHMGA1SMIM29: 34 245 865–34 249 113, řetězec zpětnémSMIM29NUDT3: 34 263 257–34 392 832, řetězec zpětnémNUDT3RPS10-NUDT3: 34 284 887–34 426 071, řetězec zpětnémRPS10-NUDT3RPS10: 34 417 447–34 426 237, řetězec zpětnémRPS10PACSIN1: 34 466 040–34 536 261, řetězec dopřednémPACSIN1SPDEF: 34 537 802–34 556 329, řetězec zpětnémSPDEFILRUN: 34 587 281–34 696 884, řetězec zpětnémILRUNSNRPC: 34 757 097–34 774 045, řetězec dopřednémSNRPCBLTP3A: 34 792 024–34 885 350, řetězec dopřednémBLTP3ATAF11: 34 829 083–34 889 192, řetězec zpětnémTAF11ANKS1A: 34 889 243–35 091 421, řetězec dopřednémANKS1ASchéma SPDEF: 6 exonů na zpětném řetězci chromozomu 6Exon 6: 34 537 802–34 538 452, 651 bázíExon 5: 34 539 250–34 539 396, 147 bázíExon 4: 34 539 515–34 539 562, 48 bázíExon 3: 34 540 984–34 541 181, 198 bázíExon 2: 34 544 020–34 544 484, 465 bázíExon 1: 34 555 929–34 556 329, 401 bází64215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 1,9 kb z 18,5 kb genu; 1 008 těchto bází kódují protein.

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen SPDEF: SAM pointed domain containing ETS transcription factor. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/spdef

Vancouver

Dante Labs. Gen SPDEF: SAM pointed domain containing ETS transcription factor [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/spdef

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test