Gen
FAM43B
family with sequence similarity 43 member B
- HGNC 31791↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000183114↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 163933↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 1p36.12
- Coordenadas
- Cromosoma 1: 20.552.573–20.555.020 (GRCh38)
- Exones
- 1 exón en 2,4 kb
- Proteína
- 329 aminoácidos
- También conocido como
- FLJ44952
- Transcrito MANE Select
- ENST00000332947.6NM_207334.3
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Estructura de FAM43B
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 2,4 kb de los 2,4 kb del gen; 990 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de FAM43B
15Moderada
Dificultad de secuenciar FAM43B con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Algunos exones de FAM43B están donde las lecturas cortas pueden pasar por alto o colocar mal un cambio.
Lo que lo agrava: la proporción de exones de FAM43B en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos en los que las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 100.0 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con un 90 % de identidad o más. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 60.0 %
- Compartido con chrYLas regiones pseudoautosómicas y la región transpuesta de X, donde chrX y chrY tienen la misma secuencia o casi la misma, por lo que una lectura de uno puede ubicarse en el otro. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 60.0 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia a la que las lecturas puedan alinearse. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 50.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y pueden no abarcarlos. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 30.7,1 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma escasa. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 20.65 %
Una puntuación de Dante Labs basada en investigación propia, construida sobre los mapas de regiones de difícil secuenciación Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de exones de FAM43B que están en ese tipo de región difícil. Cualquier tipo puede por sí solo hacer difícil un gen, y cada tipo adicional suma menos: 0 cuando ninguna base está en ninguno, 100 cuando todas las bases están donde las lecturas no pueden ubicarse de forma única.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
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Dante Labs. (s. f.). Gen FAM43B: family with sequence similarity 43 member B. Consultado el 19 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/fam43b
Dante Labs. Gen FAM43B: family with sequence similarity 43 member B [Internet]. [citado 19 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/fam43b
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