Gen
CCDC93
CCC complex scaffolding subunit CCDC93
- HGNC 25611↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000125633↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 54520↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 2q14.1
- Coordenadas
- Cromosoma 2: 117.915.481–118.014.070 (GRCh38)
- Exones
- 24 exones en 98,6 kb
- Proteína
- 631 aminoácidos
- También conocido como
- FLJ10996
- Transcrito MANE Select
- ENST00000376300.7NM_019044.5
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Obtener mi Genome TestInformes revisados relevantes para este gen
Ningún informe de Genome Test lee aún CCDC93. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.
Estructura de CCDC93
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 6,8 kb de los 98,6 kb del gen; 1896 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de CCDC93
0Fácil
Lo difícil que es secuenciar CCDC93 con lecturas cortas, sobre 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of CCDC93's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of CCDC93's exons in each kind of hard region
- MapeabilidadTramos donde las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada en ellos puede faltar o ser errónea. Peso 35 %.0 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con una identidad del 90 % o superior. Peso 30 %.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas resbalan y pueden no abarcarlas. Peso 15 %.1,8 %
- Contenido de GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma deficiente. Peso 10 %.1,7 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia a la que las lecturas puedan alinearse. Peso 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredCada barra es la proporción de las bases de exones de CCDC93 en ese tipo de región difícil. La puntuación las pondera según cuánto encarece cada una una llamada con lecturas cortas: 0 cuando ninguna base está en ninguna, 100 cuando cada base está en todas.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
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Dante Labs. (s. f.). Gen CCDC93: CCC complex scaffolding subunit CCDC93. Consultado el 18 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/ccdc93
Dante Labs. Gen CCDC93: CCC complex scaffolding subunit CCDC93 [Internet]. [citado 18 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/ccdc93
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