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Gen

C16orf90

chromosome 16 open reading frame 90

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
16p13.3
Koordinaten
Chromosom 16: 3.493.484–3.495.489 (GRCh38)
Exons
3 Exons über 2 kb
Protein
182 Aminosäuren, 19,6 kDa
Auch bekannt als
LOC646174
MANE-Select-Transkript
ENST00000437192.8NM_001080524.2
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet C16orf90 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von C16orf90

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
Chromosom 16, mit einer Klammer, an der C16orf90 liegt. C16orf90 und 32 Gene in der Nähe auf Chromosom 16, von 2.994.487 bis 3.994.486.Chromosom 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.33 Mb3,2 Mb3,4 Mb3,6 Mb3,8 MbGREP1: 2.988.256–3.002.295, Plus-Strang: 3.004.132–3.004.859, Plus-StrangCLDN9: 3.012.923–3.014.505, Plus-StrangCLDN6: 3.014.705–3.020.071, Minus-StrangTNFRSF12A: 3.018.445–3.022.385, Plus-StrangTHOC6: 3.022.541–3.027.755, Plus-StrangTHOC6HCFC1R1: 3.022.625–3.024.312, Minus-StrangHCFC1R1BICDL2: 3.027.682–3.036.993, Minus-StrangBICDL2MMP25: 3.046.062–3.060.729, Plus-StrangMMP25IL32: 3.064.301–3.082.192, Plus-StrangIL32ZSCAN10: 3.088.888–3.099.370, Minus-StrangZSCAN10ZNF205: 3.112.550–3.120.527, Plus-StrangZNF205ZNF213: 3.129.777–3.142.804, Plus-StrangZNF213OR1F1: 3.188.204–3.224.779, Plus-StrangOR1F1ZNF200: 3.222.324–3.236.221, Minus-StrangZNF200MEFV: 3.240.392–3.256.954, Minus-StrangMEFVZNF263: 3.263.800–3.301.705, Plus-StrangZNF263TIGD7: 3.298.390–3.305.729, Minus-StrangTIGD7ZNF75A: 3.305.385–3.320.003, Plus-StrangZNF75AOR2C1: 3.355.889–3.357.306, Plus-StrangOR2C1: 3.365.099–3.479.550, Plus-StrangZSCAN32: 3.382.081–3.401.483, Minus-StrangZSCAN32ZNF174: 3.401.194–3.409.478, Plus-StrangZNF174ZNF597: 3.432.414–3.443.539, Minus-StrangZNF597NAA60: 3.443.623–3.486.961, Plus-StrangNAA60C16orf90: 3.493.484–3.495.489, Minus-StrangC16orf90IFT38: 3.500.976–3.540.653, Plus-StrangIFT38NLRC3: 3.538.090–3.577.403, Minus-StrangNLRC3SLX4: 3.579.654–3.611.617, Minus-StrangSLX4DNASE1: 3.611.678–3.680.143, Plus-StrangDNASE1TRAP1: 3.651.639–3.717.595, Minus-StrangTRAP1CREBBP: 3.725.054–3.880.734, Minus-StrangCREBBPADCY9: 3.953.387–4.116.493, Minus-StrangADCY9Diagramm von C16orf90: 3 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 16Exon 3: 3.493.484–3.493.987, 504 BasenExon 2: 3.494.524–3.494.877, 354 BasenExon 1: 3.495.376–3.495.489, 114 Basen3215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1 kb der 2 kb des Gens aus; 549 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von C16orf90

15Mittel

Wie schwer sich C16orf90 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Einige Exons von C16orf90 liegen in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von C16orf90 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0 %
  • Homologie0 %
  • Gemeinsam mit chrY0 %
  • Abdeckung der Referenz0 %
  • Wiederholungen8,9 %
  • GC-Gehalt64 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Karten schwer zu sequenzierender Regionen von NIST (Genome in a Bottle).So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). C16orf90-Gen: chromosome 16 open reading frame 90. Abgerufen am 21. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/c16orf90

Vancouver

Dante Labs. C16orf90-Gen: chromosome 16 open reading frame 90 [Internet]. [zitiert am 21. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/c16orf90

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