Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

SMIM10L3

small integral membrane protein 10 like 3

Shrnutí

Cytogenetická poloha
7p22.1
Souřadnice
Chromozom 7: 6 329 411–6 348 967 (GRCh38)
Exony
2 exonů na 19,6 kb
Protein
68 aminokyselin
Další názvy
SAGSIN1
Transkript MANE Select
ENST00000578372.2NM_001395995.1
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen SMIM10L3. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je SMIM10L3 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 7, se závorkou u SMIM10L3. SMIM10L3 a 21 genů poblíž na chromozomu 7, od 5 839 189 do 6 839 188.Chromozom 77p22.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.36 Mb6,2 Mb6,4 Mb6,6 Mb6,8 MbOCM: 5 879 827–5 886 363, řetězec dopřednémOCMCCZ1: 5 898 692–5 926 550, řetězec dopřednémCCZ1RSPH10B: 5 925 544–5 970 702, řetězec zpětnémRSPH10BPMS2: 5 970 925–6 009 130, řetězec zpětnémPMS2AIMP2: 6 009 226–6 024 655, řetězec dopřednémAIMP2EIF2AK1: 6 022 247–6 059 240, řetězec zpětnémEIF2AK1ANKRD61: 6 031 376–6 036 552, řetězec dopřednémANKRD61USP42: 6 104 755–6 164 429, řetězec dopřednémUSP42CYTH3: 6 148 751–6 272 677, řetězec zpětnémCYTH3FAM220A: 6 329 409–6 348 981, řetězec zpětnémFAM220ASMIM10L3: 6 329 411–6 348 967, řetězec zpětnémSMIM10L3RAC1: 6 374 098–6 404 016, řetězec dopřednémRAC1DAGLB: 6 406 395–6 484 190, řetězec zpětnémDAGLBKDELR2: 6 445 953–6 484 224, řetězec zpětnémKDELR2GRID2IP: 6 496 778–6 551 461, řetězec zpětnémGRID2IPZDHHC4: 6 577 405–6 589 374, řetězec dopřednémZDHHC4INTS15: 6 589 564–6 608 785, řetězec dopřednémINTS15ZNF853: 6 615 305–6 624 290, řetězec dopřednémZNF853ZNF316: 6 637 298–6 658 279, řetězec dopřednémZNF316ZNF12: 6 688 433–6 706 979, řetězec zpětnémZNF12RSPH10B2: 6 754 101–6 799 365, řetězec dopřednémRSPH10B2CCZ1B: 6 794 134–6 826 770, řetězec zpětnémCCZ1BSchéma SMIM10L3: 2 exonů na zpětném řetězci chromozomu 7Exon 2: 6 329 411–6 331 235, 1 825 bázíExon 1: 6 348 573–6 348 967, 395 bází215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 2,2 kb z 19,6 kb genu; 207 těchto bází kódují protein.

Sekvenování SMIM10L3

52Obtížné

Jak obtížně se SMIM10L3 sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Velká část genu SMIM10L3 leží tam, kde krátká čtení mohou změnu přehlédnout nebo ji zařadit na špatné místo.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu SMIM10L3 v každém druhu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost0,5 %
  • Homologie82 %
  • Sdíleno s chrY0 %
  • Pokrytí referenční sekvence0 %
  • Repetice2,1 %
  • Obsah GC17 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen SMIM10L3: small integral membrane protein 10 like 3. Staženo 19. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/smim10l3

Vancouver

Dante Labs. Gen SMIM10L3: small integral membrane protein 10 like 3 [Internet]. [citováno 19. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/smim10l3

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test