Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

ARAP1

ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1

Shrnutí

Cytogenetická poloha
11q13.4
Souřadnice
Chromozom 11: 72 685 069–72 752 408 (GRCh38)
Exony
35 exonů na 67,3 kb
Protein
1 450 aminokyselin
Předchozí symboly
CENTD2
Transkript MANE Select
ENST00000393609.8NM_001040118.3
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen ARAP1. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je ARAP1 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 11, se závorkou u ARAP1. ARAP1 a 9 genů poblíž na chromozomu 11, od 72 218 739 do 73 218 738.Chromozom 1111q13.4p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2572,4 Mb72,6 Mb72,8 Mb73 Mb73,2 MbFOLR2: 72 216 601–72 221 957, řetězec dopřednémFOLR2INPPL1: 72 223 524–72 239 184, řetězec dopřednémINPPL1PHOX2A: 72 239 077–72 245 664, řetězec zpětnémPHOX2ACLPB: 72 285 495–72 434 680, řetězec zpětnémCLPBPDE2A: 72 576 141–72 674 591, řetězec zpětnémPDE2AARAP1: 72 685 069–72 752 408, řetězec zpětnémARAP1STARD10: 72 753 216–72 794 047, řetězec zpětnémSTARD10ATG16L2: 72 814 138–72 845 036, řetězec dopřednémATG16L2FCHSD2: 72 836 042–73 142 485, řetězec zpětnémFCHSD2P2RY2: 73 216 664–73 242 427, řetězec dopřednémP2RY2Schéma ARAP1: 35 exonů na zpětném řetězci chromozomu 11Exon 35: 72 685 069–72 685 681, 613 bázíExon 34: 72 686 042–72 686 191, 150 bázíExon 33: 72 687 439–72 687 502, 64 bázíExon 32: 72 687 688–72 687 738, 51 bázíExon 31: 72 688 455–72 688 537, 83 bázíExon 30: 72 692 753–72 692 785, 33 bázíExon 29: 72 693 325–72 693 470, 146 bázíExon 28: 72 693 692–72 693 805, 114 bázíExon 27: 72 694 980–72 695 097, 118 bázíExon 26: 72 695 387–72 695 455, 69 bázíExon 25: 72 695 542–72 695 628, 87 bázíExon 24: 72 695 718–72 695 865, 148 bázíExon 23: 72 696 549–72 696 654, 106 bázíExon 22: 72 696 983–72 697 195, 213 bázíExon 21: 72 697 323–72 697 486, 164 bázíExon 20: 72 697 598–72 697 649, 52 bázíExon 19: 72 697 911–72 698 106, 196 bázíExon 18: 72 699 005–72 699 107, 103 bázíExon 17: 72 699 417–72 699 552, 136 bázíExon 16: 72 701 649–72 701 783, 135 bázíExon 15: 72 702 905–72 703 079, 175 bázíExon 14: 72 704 152–72 704 334, 183 bázíExon 13: 72 705 805–72 705 890, 86 bázíExon 12: 72 707 175–72 707 374, 200 bázíExon 11: 72 709 870–72 709 976, 107 bázíExon 10: 72 710 385–72 710 587, 203 bázíExon 9: 72 711 021–72 711 141, 121 bázíExon 8: 72 711 430–72 711 499, 70 bázíExon 7: 72 712 196–72 712 339, 144 bázíExon 6: 72 712 438–72 712 568, 131 bázíExon 5: 72 713 176–72 713 243, 68 bázíExon 4: 72 714 152–72 714 321, 170 bázíExon 3: 72 726 620–72 727 172, 553 bázíExon 2: 72 732 515–72 732 597, 83 bázíExon 1: 72 752 328–72 752 408, 81 bází353025201510515′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 5,2 kb z 67,3 kb genu; 4 353 těchto bází kódují protein.

Sekvenování ARAP1

5Snadné

Jak obtížně se ARAP1 sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu ARAP1 leží v místech, kde se krátká čtení mapují čistě.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu ARAP1 v každém typu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost0 %
  • Homologie0 %
  • Repetice1,7 %
  • Obsah GC46 %
  • Referenční pokrytí0 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, založené na mapách obtížně sekvenovatelných oblastí Genome in a Bottle od NIST.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen ARAP1: ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/arap1

Vancouver

Dante Labs. Gen ARAP1: ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/arap1

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test