Talasemie – nejčastější monogenová porucha na světě, u níž celkový globinový genotyp určuje, zda je daná osoba bezpříznakovým nosičem, trpí léčitelným chronickým onemocněním, nebo má onemocnění vyžadující transfuze.
Sekvenování celého genomu zachycuje kompletní genové klastry alfa-globinu (HBA1/HBA2) a beta-globinu (HBB) a identifikuje každou deleci, bodovou mutaci i kombinaci složených heterozygotů – tedy celou strukturu, kterou standardní screening nosičství nedokáže zachytit.
Talasemie
Syndromy talasemie jsou autozomálně recesivní hemoglobinopatie způsobené sníženou nebo zcela chybějící produkcí alfa- nebo beta-globinových řetězců, což vede k nerovnováze v syntéze globinových řetězců, neúčinné erytropoéze a chronické hemolytické anémii. Celkově jsou talasemie nejčastějšími monogenními poruchami na světě – odhadem 270 milionů lidí je nositeli varianty talasemie a každoročně se rodí přibližně 60 000 těžce postižených dětí. Četnost nosičů talasemie je nejvyšší v oblastech, kde je malárie endemická: ve Středomoří, subsaharské Africe, na Blízkém východě, v jižní a jihovýchodní Asii a v jižní Číně.
Alfa-talasemie je způsobena delecemi nebo mutacemi genů HBA1 a HBA2 na chromozomu 16p13.3. Jelikož existují čtyři kopie genů alfa-globinu (dva geny HBA1 a dva geny HBA2 na každém chromozomu 16), závažnost alfa-thalassémie se řídí dávkovým gradientem: jeden gen delecí (alfa-thalassémie, tichý nosič), dva geny delecí (alfa-thalassémie, znak), tři geny delecí (HbH choroba, mírná anémie), čtyři geny delecí (Hb Bartův hydrops fetalis, bez zásahu vždy smrtelný v děloze). Beta-thalassémie je způsobena bodovými mutacemi nebo malými inzercemi/delecemi v genu HBB. Beta-thalassémie major (Cooleyova anémie, beta⁰/beta⁰) vyžaduje celoživotní transfuze; beta-thalassémie intermedia má variabilní závažnost; beta-thalassemický znak je asymptomatický.
Genetická struktura talasemie patří k nejkomplexnějším ze všech mendelovských poruch. Bylo popsáno více než 300 variant beta-globinu a desítky typů delecí alfa-globinu. Složená heterozygotnost – tedy zdědění různých variant talasemie od každého z rodičů – vede k fenotypům, které nelze předpovědět na základě žádné z těchto variant samostatně. Společné zdědění alfa- a beta-talasemie mění závažnost onemocnění: souběžná alfa-talasemie snižuje nerovnováhu globinových řetězců u beta-talasemie, čímž paradoxně stav zlepšuje. Genová terapie (betibeglogene autotemcel, schválena v roce 2022) a editace genů (exagamglogene autotemcel/exa-cel, schválena v roce 2023) nabízejí léčebný potenciál pro pacienty závislé na transfuzích, díky čemuž definitivní genotypizace přímo umožňuje léčbu.
Alfa- a beta-talasemie se vyznačují odlišnými geny a způsoby dědičnosti. Kombinace složených heterozygotních variant vedou ke vzniku odlišných klinických fenotypů, které nelze předpovědět pouze na základě testování jednotlivých variant.
Standardní screeningové testy na běžné regionální varianty talasemie. Neumožňují určit úplný genotyp s delecí alfa-globinu, stavy složeného heterozygotismu ani modifikující lokusy, které určují klinickou závažnost onemocnění a reprodukční riziko.
Počet kopií genu pro alfa-globin vyžaduje rozlišení na úrovni genomu – pomocí panelů SNP jej nelze určit
Alfa-talasemie je způsobena převážně rozsáhlými delecemi, při nichž dochází k odstranění jednoho nebo obou genů pro alfa-globin z chromozomu. Stanovení počtu zbývajících funkčních kopií genů pro alfa-globin – což je hlavní faktor určující klinickou závažnost onemocnění – vyžaduje mapování delece včetně charakterizace zlomových bodů. Panely pro screening nosičství založené na SNP nedokážou detekovat genové delece. I cílené testování delecí (MLPA, Gap-PCR) vyhodnocuje pouze nejběžnější typy regionálních delecí a může přehlédnout vzácné nebo atypické delece. Sekvenování celého genomu mapuje všechny delece alfa-globinu, určuje přesný počet kopií genu a charakterizuje zlomy – informace potřebné k rozlišení alfa-thalassemického znaku (konfigurace delecí „cis“ vs. „trans“) a k předpovědi rizika hydropsu fetalis.
K tomu, aby byl pacient způsobilý pro genovou terapii, je zapotřebí definitivní genotyp – nikoli výsledek screeningového vyšetření
Díky schválení přípravků betibeglogene autotemcel (Zynteglo, 2022) a exa-cel (Casgevy, 2023) pro léčbu beta-thalassémie závislé na transfuzích se definitivní genotypizace HBB stala přímým předpokladem pro zahájení léčby. Kritéria způsobilosti pro genovou terapii specifikují genotyp beta-thalassémie a v některých protokolech vylučují určité varianty. U pacientů, kteří jsou hodnoceni pro kurativní genovou terapii nebo úpravu genů, musí být s jistotou stanoven kompletní globinový genotyp – včetně identifikace jakékoli spoludědičné alfa-thalassémie, která by mohla ovlivnit odpověď na léčbu. Sekvenování celého genomu poskytuje tento definitivní genotyp v jediném komplexním testu.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o talasemii či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
