Spinocerebelární ataxie – více než 40 genetických podtypů progresivní degenerace mozečku, u nichž dochází k rychlému pokroku v klinických studiích s antisense oligonukleotidy a kde identifikace molekulárního podtypu určuje vhodnost pro genově specifické terapie.
Sekvenování celého genomu umožňuje v rámci jedné komplexní analýzy vyhodnotit všech více než 40 genů SCA – včetně expanzí CAG-opakování (SCA1/2/3/6/7/17), expanzí nekódujících opakování (SCA8/10/36) a konvenčních mutací (SCA5/11/13/14).
Spinocerebelární ataxie
Spinocerebelární ataxie (SCA) představují skupinu více než 40 autozomálně dominantních progresivních degenerativních onemocnění mozečku, které jsou označovány čísly od SCA1 do SCA48+ v závislosti na identifikaci nových genů. Celosvětově nejčastějšími SCA jsou SCA3/Machado-Josephova choroba (expanze CAG v genu ATXN3, ~21 % celosvětově), SCA2 (expanze CAG v genu ATXN2, ~15 %), SCA6 (expanze CAG v genu CACNA1A, ~15 %), SCA1 (expanze CAG v genu ATXN1, ~6 %) a SCA7 (expanze CAG v genu ATXN7, ~5 %). Celková prevalence SCA je přibližně 1–5 případů na 100 000 obyvatel, přičemž se liší v závislosti na populaci a geografické poloze.
SCA se projevují progresivní cerebelární ataxií (nestabilita chůze, dysartrie, poruchy očního pohybu) s různými doprovodnými příznaky v závislosti na konkrétním podtypu: SCA1 a SCA2 zahrnují pyramidální příznaky a periferní neuropatii; SCA3 zahrnuje dystonii, oftalmoplegii a parkinsonismus; SCA6 je čistá cerebelární ataxie s pozdním nástupem; SCA7 zahrnuje progresivní degeneraci sítnice (jediná SCA s makulární dystrofií). Věk nástupu koreluje nepřímo s délkou expanze repetice (anticipace — delší repetice způsobují dřívější nástup v následujících generacích, zejména při otcovském přenosu).
Terapie založené na antisense oligonukleotidech (ASO), které se zaměřují na transkripty mRNA kódující polyglutamin, jsou v současné době v klinických studiích pro SCA1, SCA2 a SCA3 – tři nejčastější typy SCA s polyglutaminem. Cílem těchto přístupů založených na potlačení genové exprese je snížit produkci toxických proteinů. Kromě toho se zkoumají také modulátory iontových kanálů a malé molekuly zaměřené na následné signální dráhy vedoucí k degeneraci mozečku. Podmínkou pro zařazení do všech studií je potvrzený molekulární podtyp SCA. Význam včasné molekulární diagnostiky přesahuje rámec současného zařazování do studií: studie přirozeného vývoje, které stanovují měřítka výsledků pro budoucí studie, rovněž vyžadují genotypizované účastníky.
SCA7 je jediným typem SCA, u něhož dochází k degeneraci sítnice – u každého pacienta s progresivní ataxií a makulární dystrofií by mělo být provedeno vyšetření na počet repetic v genu ATXN7. Sítnicová složka onemocnění může předcházet ataxii a napodobovat izolovanou sítnicovou dystrofii.
Více než 40 podtypů SCA nelze testovat postupně. Díky technologii detekce opakujících se sekvencí lze nyní pomocí WGS identifikovat CAG-sekvenční expanze a nekódující repetice, k čemuž byly dříve zapotřebí specializované testy.
ASO terapie pro SCA1/2/3 v klinických studiích – molekulární podtyp určuje vhodnost pro přístupy založené na genově specifickém potlačení
Antisense oligonukleotidy určené k potlačení exprese mRNA genů ATXN1 (SCA1), ATXN2 (SCA2) nebo ATXN3 (SCA3) jsou genově specifické – ASO pro SCA1 neléčí SCA3 a naopak. Zařazení do klinické studie vyžaduje potvrzenou molekulární diagnózu s dokumentovanou délkou expanze repetice. Bez molekulární subtypizace nemají pacienti s klinicky nerozlišitelnou progresivní cerebelární ataxií přístup ke studiím zaměřeným na konkrétní gen. WGS identifikuje konkrétní podtyp SCA na základě jediného testu, čímž končí postupné testování jednotlivých genů, které zdržuje zařazení do studie.
Včasná diagnostika znamená, že u dětí pacientů s SCA se mohou příznaky objevit o desítky let dříve – testování v presymptomatické fázi umožňuje plánování a budoucí zařazení do klinických studií
Expanze CAG-sekvencí u SCA1/2/3/7 vykazují jev zvaný anticipace – mezigenerační nestabilita sekvencí (zejména při otcovském přenosu) vede u potomků k delším sekvencím, což způsobuje časnější nástup a závažnější průběh onemocnění. Rodič s nástupem SCA3 ve věku 45 let může mít dítě s nástupem ve věku 25 let. Presymptomatické testování identifikuje ohrožené členy rodiny před nástupem příznaků, což umožňuje zařazení do preventivních studií, plánování života a okamžitý přístup ke klinickým studiím, jakmile se příznaky objeví. Před presymptomatickým testováním je nezbytné genetické poradenství.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o spinocerebelární ataxii nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
